RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299705.9

TMED3-201, Transcript of transmembrane p24 trafficking protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMED3, Length 1,475 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3-201ENST00000299705 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.16■■□□□ 1.14
TMED3-201ENST00000299705 MED23Q9ULK4 1368 aa22.16■■□□□ 1.14
TMED3-201ENST00000299705 IRS2Q9Y4H2 1338 aa22.16■■□□□ 1.14
TMED3-201ENST00000299705 TIMM10P62072 90 aa22.15■■□□□ 1.14
TMED3-201ENST00000299705 NUCB1Q02818 461 aa22.15■■□□□ 1.14
TMED3-201ENST00000299705 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
TMED3-201ENST00000299705 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
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TMED3-201ENST00000299705 WASHC4Q2M389 1173 aa22.15■■□□□ 1.14
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TMED3-201ENST00000299705 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.14■■□□□ 1.13
TMED3-201ENST00000299705 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.14■■□□□ 1.13
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TMED3-201ENST00000299705 TXNRD3Q86VQ6 643 aa22.12■■□□□ 1.13
TMED3-201ENST00000299705 XAGE2Q96GT9 111 aa22.12■■□□□ 1.13
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TMED3-201ENST00000299705 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.11■■□□□ 1.13
TMED3-201ENST00000299705 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TMED3-201ENST00000299705 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
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TMED3-201ENST00000299705 ZNF804AQ7Z570 1209 aa22.09■■□□□ 1.13
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TMED3-201ENST00000299705 LNPKQ9C0E8 428 aa22.09■■□□□ 1.13
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TMED3-201ENST00000299705 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
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TMED3-201ENST00000299705 VPS37DQ86XT2 251 aa22.08■■□□□ 1.12
TMED3-201ENST00000299705 LARGE2Q8N3Y3 721 aa22.08■■□□□ 1.12
TMED3-201ENST00000299705 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.07■■□□□ 1.12
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TMED3-201ENST00000299705 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.05■■□□□ 1.12
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TMED3-201ENST00000299705 ECE2O60344 883 aa22.03■■□□□ 1.12
TMED3-201ENST00000299705 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
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TMED3-201ENST00000299705 MX1P20591 662 aa22.03■■□□□ 1.12
TMED3-201ENST00000299705 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.03■■□□□ 1.12
TMED3-201ENST00000299705 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
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TMED3-201ENST00000299705 ZNRF3Q9ULT6 936 aa22.03■■□□□ 1.12
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TMED3-201ENST00000299705 RNF181Q9P0P0 153 aa22.01■■□□□ 1.11
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TMED3-201ENST00000299705 FZD9O00144 591 aa22■■□□□ 1.11
TMED3-201ENST00000299705 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22■■□□□ 1.11
TMED3-201ENST00000299705 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22■■□□□ 1.11
TMED3-201ENST00000299705 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22■■□□□ 1.11
TMED3-201ENST00000299705 AOX1Q06278 1338 aa21.99■■□□□ 1.11
TMED3-201ENST00000299705 ERC2O15083 957 aa21.99■■□□□ 1.11
TMED3-201ENST00000299705 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
TMED3-201ENST00000299705 RASGRF1Q13972 1273 aa21.99■■□□□ 1.11
TMED3-201ENST00000299705 CHD4Q14839 1912 aa21.99■■□□□ 1.11
TMED3-201ENST00000299705 FAM205AQ6ZU69 1335 aa21.98■■□□□ 1.11
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