RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488013.1

HDLBP-242, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 651 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-242ENST00000488013 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 KCTD7Q96MP8 289 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 TMEM204Q9BSN7 226 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 FUNDC2Q9BWH2 189 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 CA10Q9NS85 328 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 SNTG1Q9NSN8 517 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 FAIMQ9NVQ4 179 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 ZNF319Q9P2F9 582 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 V9GYS6 101 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 FREM1Q5H8C1 2179 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 PCNX1Q96RV3 2341 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 CD300LBA8K4G0 201 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 DEFB108AA8MXU0 73 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 GABRPO00591 440 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 SLC22A1O15245 554 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 GPX5O75715 221 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 CST4P01036 141 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 UCHL1P09936 223 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 BMP4P12644 408 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 ZNF250P15622 560 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 KITLGP21583 273 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 MYL9P24844 172 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 THBS4P35443 961 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 TGFBR2P37173 567 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 CRYBB2P43320 205 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 RPS25P62851 125 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 ZNF92Q03936 586 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 DOC2BQ14184 412 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 ODF4Q2M2E3 257 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 HSD17B12Q53GQ0 312 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 GPR107Q5VW38 600 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 UTS2BQ765I0 119 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 TPRA1Q86W33 373 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 CROCCP3Q8IVE0 287 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 RDH10Q8IZV5 341 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 SPERTQ8NA61 448 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 KBTBD8Q8NFY9 601 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 OR14K1Q8NGZ2 314 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 SYNPRQ8TBG9 265 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 SLC25A40Q8TBP6 338 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 TMEM171Q8WVE6 324 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 CMBLQ96DG6 245 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 DERL3Q96Q80 235 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 OR2J1Q9GZK6 312 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 TCF7L1Q9HCS4 588 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 PTTG3PQ9NZH4 202 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 FOXJ3Q9UPW0 622 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 MPC1Q9Y5U8 109 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 ATP23Q9Y6H3 246 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 PLSCR5A0PG75 271 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 CCDC160A6NGH7 325 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 ANXA2P2A6NMY6 339 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 IQCF6A8MYZ5 107 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 PDCD5O14737 125 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 MAGEB3O15480 346 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 IGHV3-13P01766 116 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 COX6B1P14854 86 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 FSTP19883 344 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 PRKACBP22694 351 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 GADD45AP24522 165 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 SERPINF1P36955 418 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 MTNR1BP49286 362 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 FABP5Q01469 135 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 CLVS2Q5SYC1 327 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 CDH26Q8IXH8 852 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 NKAIN3Q8N8D7 197 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 OR2AE1Q8NHA4 323 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 PPP1R14AQ96A00 147 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 SPSB1Q96BD6 273 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 TMIGD2Q96BF3 282 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 PIK3IP1Q96FE7 263 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 LYZL4Q96KX0 146 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 OR14A2Q96R54 314 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 DHRS9Q9BPW9 319 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 CHST5Q9GZS9 411 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-242ENST00000488013 PIGLQ9Y2B2 252 aa9.49□□□□□ -0.89
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