RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 GRHPRQ9UBQ7 328 aa5.41□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 CLN8Q9UBY8 286 aa5.41□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 LHFPL6Q9Y693 200 aa5.41□□□□□ -1.54
HOXD8-202ENST00000429017 A0A0U1RQK1 487 aa5.4□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 HTR3EA5X5Y0 456 aa5.4□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF879B4DU55 563 aa5.4□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 PHYHO14832 338 aa5.4□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 CRYBA1P05813 215 aa5.4□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 RPSAP08865 295 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 HSD17B1P14061 328 aa5.4□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 FPR3P25089 353 aa5.4□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 RPL4P36578 427 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 CD200P41217 278 aa5.4□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 RGS6P49758 472 aa5.4□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 TRAM2Q15035 370 aa5.4□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 ANKDD1AQ495B1 522 aa5.4□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 ERICH5Q6P6B1 374 aa5.4□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 CFAP77Q6ZQR2 320 aa5.4□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 Q6ZSV7 163 aa5.4□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa5.4□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa5.4□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 GLB1L2Q8IW92 636 aa5.4□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM86BQ8N661 226 aa5.4□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 Q8TCH9 128 aa5.4□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 NRG4Q8WWG1 115 aa5.4□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 COG8Q96MW5 612 aa5.4□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 COQ7Q99807 217 aa5.4□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 FNDC11Q9BVV2 318 aa5.4□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 VCXQ9H320 206 aa5.4□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 NRIP3Q9NQ35 241 aa5.4□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 UFSP2Q9NUQ7 469 aa5.4□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM100Q9NV29 134 aa5.4□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 CMTM6Q9NX76 183 aa5.4□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 CD300AQ9UGN4 299 aa5.4□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 ATPIF1Q9UII2 106 aa5.4□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 SIGLEC7Q9Y286 467 aa5.4□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 AP4S1Q9Y587 144 aa5.4□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa5.4□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 A0A1B0GW55 424 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 AQP12BA6NM10 295 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 M0QZ24 198 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 P2RY10O00398 339 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 SOCS2O14508 198 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 XKRYO14609 159 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 ACOT8O14734 319 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 TIMM23O14925 209 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 GSTA4O15217 222 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 SHOXO15266 292 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 ENSAO43768 121 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 AHCYL1O43865 530 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 TOX4O94842 621 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 IFNA14P01570 189 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 IGHV1-69P01742 117 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 ACSM4P0C7M7 580 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 DUX4L2P0CJ85 424 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 DUX4L3P0CJ86 424 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 DUX4L4P0CJ87 422 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 DUX4L5P0CJ88 424 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 DUX4L6P0CJ89 424 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 DUX4L7P0CJ90 424 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 SDHAP31040 664 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 IER3P46695 156 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 OMPP47874 163 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 BPIFB3P59826 476 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 LIPEQ05469 1076 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 TAF9Q16594 264 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF730Q6ZMV8 503 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF620Q6ZNG0 422 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 LINC00346Q8IVM7 164 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 AQP12AQ8IXF9 295 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 PDZD9Q8IXQ8 264 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 SLC15A3Q8IY34 581 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 C1orf87Q8N0U7 546 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 OR2T12Q8NG77 320 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 SLC7A13Q8TCU3 470 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 LHX4Q969G2 390 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 DHRS1Q96LJ7 313 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 WDFY2Q96P53 400 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 TECTBQ96PL2 329 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-202ENST00000429017 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms