RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330334.7

HDDC3-201, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HDDC3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-201ENST00000330334 CD300LBA8K4G0 201 aa14.86□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 HAX1O00165 279 aa14.86□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 GMDSO60547 372 aa14.86□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 IFNGP01579 166 aa14.86□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 ENTPD1P49961 510 aa14.86□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 RAD23AP54725 363 aa14.86□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 CRMP1Q14194 572 aa14.86□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 C12orf54Q6X4T0 127 aa14.86□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 RHOUQ7L0Q8 258 aa14.86□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 DCXRQ7Z4W1 244 aa14.86□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 KLBQ86Z14 1044 aa14.86□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 OR51L1Q8NGJ5 315 aa14.86□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 OR4Q3Q8NH05 313 aa14.86□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 PLEKHA8Q96JA3 519 aa14.86□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 KCNJ15Q99712 375 aa14.86□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 SLC6A7Q99884 636 aa14.86□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 TMEM246Q9BRR3 403 aa14.86□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 MRI1Q9BV20 369 aa14.86□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 OPA3Q9H6K4 179 aa14.86□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 CMC2Q9NRP2 79 aa14.86□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 TAS2R1Q9NYW7 299 aa14.86□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 NUP50Q9UKX7 468 aa14.86□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 PPIAL4AQ9Y536 164 aa14.86□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 U3KQV3 271 aa14.86□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 RIIAD1A6NNX1 92 aa14.85□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 ACOT8O14734 319 aa14.85□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 IRF2P14316 349 aa14.85□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 RPS2P15880 293 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 SPI1P17947 270 aa14.85□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 RPS27P42677 84 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 ZNF92Q03936 586 aa14.85□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 SNAI3Q3KNW1 292 aa14.85□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 LRRN1Q6UXK5 716 aa14.85□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 NLRC3Q7RTR2 1065 aa14.85□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 SPERTQ8NA61 448 aa14.85□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 ZNF511Q8NB15 262 aa14.85□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa14.85□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 OR11L1Q8NGX0 322 aa14.85□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 SLAMF6Q96DU3 332 aa14.85□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 LRGUKQ96M69 825 aa14.85□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 CHID1Q9BWS9 393 aa14.85□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 PSKH1P11801 424 aa14.84□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 ZNF3P17036 446 aa14.84□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 CD80P33681 288 aa14.84□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 SLC15A1P46059 708 aa14.84□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 ARMCX4Q5H9R4 360 aa14.84□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 LINC01590Q5TEZ4 76 aa14.84□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 LYPD4Q6UWN0 246 aa14.84□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 DCDC5Q6ZRR9 648 aa14.84□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 ZDHHC22Q8N966 263 aa14.84□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 OR10G2Q8NGC3 310 aa14.84□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 RAB40AQ8WXH6 277 aa14.84□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 SPSB4Q96A44 273 aa14.84□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 COPS4Q9BT78 406 aa14.84□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 TOR3AQ9H497 397 aa14.84□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 ARMC1Q9NVT9 282 aa14.84□□□□□ -0.03
HDDC3-201ENST00000330334 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa14.83□□□□□ -0.04
HDDC3-201ENST00000330334 GGT3PA6NGU5 568 aa14.83□□□□□ -0.04
HDDC3-201ENST00000330334 AQP12BA6NM10 295 aa14.83□□□□□ -0.04
HDDC3-201ENST00000330334 ZNF878C9JN71 531 aa14.83□□□□□ -0.04
HDDC3-201ENST00000330334 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
HDDC3-201ENST00000330334 ZNF205O95201 554 aa14.83□□□□□ -0.04
HDDC3-201ENST00000330334 SOX14O95416 240 aa14.83□□□□□ -0.04
HDDC3-201ENST00000330334 GYPBP06028 91 aa14.83□□□□□ -0.04
HDDC3-201ENST00000330334 SPARCP09486 303 aa14.83□□□□□ -0.04
HDDC3-201ENST00000330334 CA6P23280 308 aa14.83□□□□□ -0.04
HDDC3-201ENST00000330334 DDOSTP39656 456 aa14.83□□□□□ -0.04
HDDC3-201ENST00000330334 PRSS12P56730 875 aa14.83□□□□□ -0.04
HDDC3-201ENST00000330334 GNB2P62879 340 aa14.83□□□□□ -0.04
HDDC3-201ENST00000330334 GRB2P62993 217 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
HDDC3-201ENST00000330334 ACTG1P63261 375 aa14.83□□□□□ -0.04
HDDC3-201ENST00000330334 TAF13Q15543 124 aa14.83□□□□□ -0.04
HDDC3-201ENST00000330334 OR8G1Q15617 311 aa14.83□□□□□ -0.04
HDDC3-201ENST00000330334 KCNJ8Q15842 424 aa14.83□□□□□ -0.04
HDDC3-201ENST00000330334 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
HDDC3-201ENST00000330334 GLYATL3Q5SZD4 288 aa14.83□□□□□ -0.04
HDDC3-201ENST00000330334 BTNL3Q6UXE8 466 aa14.83□□□□□ -0.04
HDDC3-201ENST00000330334 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
HDDC3-201ENST00000330334 DOK3Q7L591 496 aa14.83□□□□□ -0.04
HDDC3-201ENST00000330334 AQP12AQ8IXF9 295 aa14.83□□□□□ -0.04
HDDC3-201ENST00000330334 ADGRG5Q8IZF4 528 aa14.83□□□□□ -0.04
HDDC3-201ENST00000330334 OR8B3Q8NGG8 313 aa14.83□□□□□ -0.04
HDDC3-201ENST00000330334 TEX47Q8TBZ9 253 aa14.83□□□□□ -0.04
HDDC3-201ENST00000330334 GIPC3Q8TF64 312 aa14.83□□□□□ -0.04
HDDC3-201ENST00000330334 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
HDDC3-201ENST00000330334 OR8B2Q96RD0 313 aa14.83□□□□□ -0.04
HDDC3-201ENST00000330334 FEVQ99581 238 aa14.83□□□□□ -0.04
HDDC3-201ENST00000330334 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa14.83□□□□□ -0.04
HDDC3-201ENST00000330334 SP140LQ9H930 580 aa14.83□□□□□ -0.04
HDDC3-201ENST00000330334 MARCH7Q9H992 704 aa14.83□□□□□ -0.04
HDDC3-201ENST00000330334 FN3KRPQ9HA64 309 aa14.83□□□□□ -0.04
HDDC3-201ENST00000330334 ESM1Q9NQ30 184 aa14.83□□□□□ -0.04
HDDC3-201ENST00000330334 CENPMQ9NSP4 180 aa14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms