RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511481.5

SEC24D-211, Transcript of SEC24 homolog D, COPII coat complex component, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SEC24D, Length 2,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24D-211ENST00000511481 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 DERL3Q96Q80 235 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 CLCC1Q96S66 551 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 ACBD6Q9BR61 282 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 CHST6Q9GZX3 395 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 MED20Q9H944 212 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 RNF122Q9H9V4 155 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 CDH20Q9HBT6 801 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 UQCC1Q9NVA1 299 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 CRLS1Q9UJA2 301 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 LAMP3Q9UQV4 416 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 PTPRDP23468 1912 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 KIAA1671Q9BY89 1806 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 A0A0D9SG52 128 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 DAPL1A0PJW8 107 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 J3QLW9 94 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 J3QRE1 110 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 RHODO00212 210 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 NARSO43776 548 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 GPRIN2O60269 458 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 PCCBP05166 539 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 ZNF19P17023 458 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 GSTM3P21266 225 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 ACRV1P26436 265 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 SPAM1P38567 509 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 HTR5AP47898 357 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 POU3F4P49335 361 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 CLDN12P56749 244 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 BDH1Q02338 343 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 GAGE2BQ13066 116 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 TEAD2Q15562 447 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 GAGE2EQ4V326 116 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 FAM76BQ5HYJ3 339 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 NCMAPQ5T1S8 102 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 GAGE2AQ6NT46 116 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 DLK2Q6UY11 383 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 NRROSQ86YC3 692 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 ZNF561Q8N587 486 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 KCNRGQ8N5I3 272 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 ZNF383Q8NA42 475 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 OR56B1Q8NGI3 324 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 OR4A4PQ8NGN8 299 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 CD99L2Q8TCZ2 262 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 DNAJB3Q8WWF6 145 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 GHSRQ92847 366 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 FAM46BQ96A09 425 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 TMEM18Q96B42 140 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 ZPBPQ9BS86 351 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 EDEM2Q9BV94 578 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 ACKR4Q9NPB9 350 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 GAGE2DQ9UEU5 116 aa4.88□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 LTBP4Q8N2S1 1624 aa4.87□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 HELZP42694 1942 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 TRAPPC13A5PLN9 417 aa4.87□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 SLC16A5O15375 505 aa4.87□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 PPIHO43447 177 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 BCL2L11O43521 198 aa4.87□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 B3GAT3O94766 335 aa4.87□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 IGHV2-5P01817 119 aa4.87□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 PTNP21246 168 aa4.87□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 UQCRC2P22695 453 aa4.87□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 AKT2P31751 481 aa4.87□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 MPIP34949 423 aa4.87□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 PTH2RP49190 550 aa4.87□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 P2RX1P51575 399 aa4.87□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 TAS2R60P59551 318 aa4.87□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 RAB2AP61019 212 aa4.87□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 RPS15P62841 145 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 ZNF763Q0D2J5 394 aa4.87□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 GPNMBQ14956 572 aa4.87□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 TAF13Q15543 124 aa4.87□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 SYPL1Q16563 259 aa4.87□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 TMEM44Q2T9K0 475 aa4.87□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 TEX30Q5JUR7 227 aa4.87□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 UBE2NLQ5JXB2 153 aa4.87□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 STPG1Q5TH74 334 aa4.87□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 OLFML2AQ68BL7 652 aa4.87□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 BTNL8Q6UX41 500 aa4.87□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa4.87□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 FCRLAQ7L513 359 aa4.87□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 SSX6Q7RTT6 188 aa4.87□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 MED8Q96G25 268 aa4.87□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 SEC11CQ9BY50 192 aa4.87□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 TTTY10Q9BZA0 68 aa4.87□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 EGLN1Q9GZT9 426 aa4.87□□□□□ -1.63
SEC24D-211ENST00000511481 LAT2Q9GZY6 243 aa4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.2 ms