RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BGNP21810 368 aa13.56□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CD200P41217 278 aa13.56□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RPL27P61353 136 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAB21L1Q13394 359 aa13.56□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DUSP7Q16829 419 aa13.56□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LRIF1Q5T3J3 769 aa13.56□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PGBD2Q6P3X8 592 aa13.56□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 WFDC9Q8NEX5 89 aa13.56□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPP1R35Q8TAP8 253 aa13.56□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LIPHQ8WWY8 451 aa13.56□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SGTBQ96EQ0 304 aa13.56□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 B9D2Q9BPU9 175 aa13.56□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ECSITQ9BQ95 431 aa13.56□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM234AQ9H0X4 552 aa13.56□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa13.56□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATPIF1Q9UII2 106 aa13.56□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAB21L2Q9Y586 359 aa13.56□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GMEB1Q9Y692 573 aa13.56□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FBP2O00757 339 aa13.55□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HLA-DPB1P04440 258 aa13.55□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGLL1P15814 213 aa13.55□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CD247P20963 164 aa13.55□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RBM34P42696 430 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RAD23AP54725 363 aa13.55□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IFFO1Q0D2I5 559 aa13.55□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR8B8Q15620 311 aa13.55□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ALG10Q5BKT4 473 aa13.55□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C10orf111Q8N326 155 aa13.55□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR9I1Q8NGQ6 314 aa13.55□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRSS27Q9BQR3 290 aa13.55□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HCAR1Q9BXC0 346 aa13.55□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EMC7Q9NPA0 242 aa13.55□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UFSP2Q9NUQ7 469 aa13.55□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ONECUT1Q9UBC0 465 aa13.55□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A6NIZ1 184 aa13.54□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EVPLLA8MZ36 301 aa13.54□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 H3BUX3 64 aa13.54□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DVL1O14640 695 aa13.54□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OPN1SWP03999 348 aa13.54□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RAP1BP61224 184 aa13.54□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RAP1AP62834 184 aa13.54□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AQP6Q13520 282 aa13.54□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LAPTM4AQ15012 233 aa13.54□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LRRC8CQ8TDW0 803 aa13.54□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC7A6Q92536 515 aa13.54□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MEIOCA2RUB1 952 aa13.53□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR6C6A6NF89 314 aa13.53□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OOEPA6NGQ2 149 aa13.53□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C3orf84H3BNL1 204 aa13.53□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UBDO15205 165 aa13.53□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SCG5P05408 212 aa13.53□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPX2P18283 190 aa13.53□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SAA4P35542 130 aa13.53□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ACSM1Q08AH1 577 aa13.53□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DOC2BQ14184 412 aa13.53□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MPPED2Q15777 294 aa13.53□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa13.53□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MSRB3Q8IXL7 192 aa13.53□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLPP7Q8NBV4 271 aa13.53□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BEND2Q8NDZ0 799 aa13.53□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPR32P1Q8NGA4 272 aa13.53□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR1F12Q8NHA8 337 aa13.53□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PFN4Q8NHR9 129 aa13.53□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP13.53□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ST8SIA4Q92187 359 aa13.53□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa13.53□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SIRT7Q9NRC8 400 aa13.53□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KAAG1Q9UBP8 84 aa13.53□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HIF3AQ9Y2N7 669 aa13.53□□□□□ -0.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 E9PQ18 207 aa13.52□□□□□ -0.25
RFX3-AS1-201ENST00000423112 M0QX08 132 aa13.52□□□□□ -0.25
RFX3-AS1-201ENST00000423112 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KLHL22Q53GT1 634 aa13.52□□□□□ -0.25
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZBTB37Q5TC79 503 aa13.52□□□□□ -0.25
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C11orf65Q8NCR3 313 aa13.52□□□□□ -0.25
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LY6G5BQ8NDX9 201 aa13.52□□□□□ -0.25
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR4D11Q8NGI4 311 aa13.52□□□□□ -0.25
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC22A4Q9H015 551 aa13.52□□□□□ -0.25
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C20orf141Q9NUB4 165 aa13.52□□□□□ -0.25
RFX3-AS1-201ENST00000423112 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa13.51□□□□□ -0.25
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GYPAP02724 150 aa13.51□□□□□ -0.25
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CD28P10747 220 aa13.51□□□□□ -0.25
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAHP16930 419 aa13.51□□□□□ -0.25
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UBE2E1P51965 193 aa13.51□□□□□ -0.25
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LIAT1Q6ZQX7 453 aa13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.1 ms