RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392449.4

PTPRK-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 2

Gene PTPRK, Length 1,456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-208	ENST00000392449	AQP6	Q13520	282 aa		14	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	DGCR6	Q14129	220 aa		14	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	14	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	14	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		14	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	OR5AS1	Q8N127	324 aa		14	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		14	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	C7orf34	Q96L11	122 aa		14	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	SLC6A7	Q99884	636 aa		14	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	NUAK2	Q9H093	628 aa		14	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		14	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		14	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		14	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	OPN4	Q9UHM6	478 aa		14	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	OR6C6	A6NF89	314 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	IGHV2-70	P01814	119 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	COX5B	P10606	129 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	LIPA	P38571	399 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	GLYAT	Q6IB77	296 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	ARL9	Q6T311	187 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	FAM107B	Q9H098	131 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	ADA2	Q9NZK5	511 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	NPTN	Q9Y639	398 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	UNC119B	A6NIH7	251 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	PPP1R3D	O95685	299 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	RHCE	P18577	417 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	KITLG	P21583	273 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	CENPA	P49450	140 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	PRSS12	P56730	875 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	CORO6	Q6QEF8	472 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	DIRC2	Q96SL1	478 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	FUZ	Q9BT04	418 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	MMP26	Q9NRE1	261 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449		A0A0A6YYJ9	748 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	AHCYL1	O43865	530 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	HILS1	P60008	231 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	ACTG1	P63261	375 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	SLC3A1	Q07837	685 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	ZMYND11	Q15326	602 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	WDR76	Q9H967	626 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	ESM1	Q9NQ30	184 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	AURKC	Q9UQB9	309 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	ZNF205	O95201	554 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	CFP	P27918	469 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	OR2T2	Q6IF00	324 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	FANK1	Q8TC84	345 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	ST7L	Q8TDW4	575 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	HAVCR1	Q96D42	359 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	OR2V2	Q96R30	315 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	WAC	Q9BTA9	647 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	FN3K	Q9H479	309 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	MED4	Q9NPJ6	270 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449		H0YL77	283 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449		J3QLI3	93 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	FSHB	P01225	129 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	SEMG1	P04279	462 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	SPIB	Q01892	262 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	SCGB2A2	Q13296	93 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRK-208	ENST00000392449	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		13.96	□□□□□ -0.17

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