RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, human

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRF-211	ENST00000467464	WAC	Q9BTA9	647 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	OR6C6	A6NF89	314 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	SPRY3	O43610	288 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	DOK2	O60496	412 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	MPZL1	O95297	269 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	AVP	P01185	164 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	GCH1	P30793	250 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	PSG7	Q13046	419 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464		Q6ZR03	302 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	OR51F2	Q8NH61	342 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	SYT4	Q9H2B2	425 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	CD300A	Q9UGN4	299 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	CLDN25	C9JDP6	229 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	DCTN6	O00399	190 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	XKRY	O14609	159 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	SGCE	O43556	437 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	PLPP2	O43688	288 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	SLC16A7	O60669	478 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	ABHD16A	O95870	558 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	MT-ND5	P03915	603 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	HSD17B1	P14061	328 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	ITGA2	P17301	1181 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	KITLG	P21583	273 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	PCMT1	P22061	227 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	HTR5A	P47898	357 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	ERF	P50548	548 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	HIST1H3A	P68431	136 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	TEK	Q02763	1124 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	CDK5R2	Q13319	367 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	AQP6	Q13520	282 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	KCNMB1	Q16558	191 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	FGD3	Q5JSP0	725 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	SLC7A6	Q92536	515 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	NUAK2	Q9H093	628 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	MSL2	Q9HCI7	577 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	DECR2	Q9NUI1	292 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	STARD10	Q9Y365	291 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	UNC119B	A6NIH7	251 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	SOCS2	O14508	198 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	ATP8B1	O43520	1251 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	TCF21	O43680	179 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	VENTX	O95231	258 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	GPANK1	O95872	356 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	HFE	Q30201	348 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	MTX3	Q5HYI7	312 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	RRM2B	Q7LG56	351 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	ADCK1	Q86TW2	530 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	OR52J3	Q8NH60	311 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	TSSK2	Q96PF2	358 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	PLSCR5	A0PG75	271 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRF-211	ENST00000467464	ARPC2	O15144	300 aa		10.11	□□□□□ -0.79

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