RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588419.1

HDAC5-208, Transcript of histone deacetylase 5, human

TSL 2

Gene HDAC5, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC5-208	ENST00000588419	NABP1	Q96AH0	204 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC5-208	ENST00000588419	TPD52L3	Q96J77	140 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC5-208	ENST00000588419	JMJD8	Q96S16	334 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC5-208	ENST00000588419	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC5-208	ENST00000588419	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
HDAC5-208	ENST00000588419	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC5-208	ENST00000588419	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
HDAC5-208	ENST00000588419	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC5-208	ENST00000588419	SIAE	Q9HAT2	523 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC5-208	ENST00000588419	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC5-208	ENST00000588419	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
HDAC5-208	ENST00000588419	BAG5	Q9UL15	447 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC5-208	ENST00000588419	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HDAC5-208	ENST00000588419	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	FBP2	O00757	339 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	MGRN1	O60291	552 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	OR5F1	O95221	314 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	IGHV3-13	P01766	116 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	IFI30	P13284	250 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	PPP1CB	P62140	327 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	PSG4	Q00888	419 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	CCDC80	Q76M96	950 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	NANP	Q8TBE9	248 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	ST7L	Q8TDW4	575 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	MAGEB18	Q96M61	343 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	MSL2	Q9HCI7	577 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	CENPBD1	B2RD01	187 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419		H7C1C5	153 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	MRAS	O14807	208 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	NR2C1	P13056	603 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	LAP3	P28838	519 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	GZMM	P51124	257 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	CTXN1	P60606	82 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	LCN6	P62502	163 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	FAM209A	Q5JX71	171 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	ZNF774	Q6NX45	483 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	SEPHS2	Q99611	448 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	RHCG	Q9UBD6	479 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	GMNC	A6NCL1	334 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419		J3QLI3	93 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	IFNA14	P01570	189 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	MMP15	P51511	669 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	ARHGDIA	P52565	204 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	SLC3A1	Q07837	685 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	SPRN	Q5BIV9	151 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	TREML1	Q86YW5	311 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	OR51A7	Q8NH64	312 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	LRRC58	Q96CX6	371 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	RBP7	Q96R05	134 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	SH3GL1	Q99961	368 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	TMEM89	A2RUT3	159 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	DOK2	O60496	412 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	PRSS23	O95084	383 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	ABHD16A	O95870	558 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	NGF	P01138	241 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	SBK2	P0C263	348 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	IFNA8	P32881	189 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	LIMS1	P48059	325 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC5-208	ENST00000588419	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55

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