RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, human

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRF-211	ENST00000467464	STOM	P27105	288 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	LAP3	P28838	519 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	MPV17	P39210	176 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	MMP15	P51511	669 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM33	P57088	247 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	LCN6	P62502	163 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	ERVK-25	P63136	954 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	CCL8	P80075	99 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	HSF2	Q03933	536 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	PLP2	Q04941	152 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	SGCA	Q16586	387 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	IFI44L	Q53G44	452 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	MEST	Q5EB52	335 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	THEM4	Q5T1C6	240 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	OR51A7	Q8NH64	312 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	FUZ	Q9BT04	418 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	C5orf49	A4QMS7	147 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	GMNC	A6NCL1	334 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	CCDC22	O60826	627 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	TF	P02787	698 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	NR2C1	P13056	603 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	NCK1	P16333	377 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	HNF1A	P20823	631 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	APLNR	P35414	380 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	RAD52	P43351	418 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	GPR4	P46093	362 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	LIMS1	P48059	325 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	SLC9A3	P48764	834 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	FXYD6P3	P58550	94 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	OAF	Q86UD1	273 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	FNDC8	Q8TC99	324 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	C7orf34	Q96L11	122 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	MED4	Q9NPJ6	270 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	POLE4	Q9NR33	117 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	CACNG2	Q9Y698	323 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464		A0A1W2PRQ8	180 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464		A6NIZ1	184 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464		B4DSR2	109 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	IMPA2	O14732	288 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	PTP4A3	O75365	173 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	NGF	P01138	241 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	CD14	P08571	375 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	GAA	P10253	952 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	MSR1	P21757	451 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	IFNA8	P32881	189 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	CRYBB2	P43320	205 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	NUDT2	P50583	147 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	RAP1B	P61224	184 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	RAP1A	P62834	184 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	GLO1	Q04760	184 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	DGCR6	Q14129	220 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF774	Q6NX45	483 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464		Q96M85	177 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	RBP7	Q96R05	134 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PTPRF-211	ENST00000467464	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		10.18	□□□□□ -0.78

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