RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539804.1

PITX3-202, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PITX3, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-202ENST00000539804 BCL2L13Q9BXK5 485 aa30.57■■■□□ 2.48
PITX3-202ENST00000539804 ANKRD2Q9GZV1 360 aa30.57■■■□□ 2.48
PITX3-202ENST00000539804 UFL1O94874 794 aa30.56■■■□□ 2.48
PITX3-202ENST00000539804 CCT4P50991 539 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
PITX3-202ENST00000539804 GJA3Q9Y6H8 435 aa30.56■■■□□ 2.48
PITX3-202ENST00000539804 UTYO14607 1347 aa30.55■■■□□ 2.48
PITX3-202ENST00000539804 ZBED9Q6R2W3 1325 aa30.55■■■□□ 2.48
PITX3-202ENST00000539804 POTECB2RU33 542 aa30.55■■■□□ 2.48
PITX3-202ENST00000539804 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
PITX3-202ENST00000539804 CCDC57Q2TAC2 916 aa30.55■■■□□ 2.48
PITX3-202ENST00000539804 CIAPIN1Q6FI81 312 aa30.55■■■□□ 2.48
PITX3-202ENST00000539804 ARHGAP45Q92619 1136 aa30.55■■■□□ 2.48
PITX3-202ENST00000539804 POLLQ9UGP5 575 aa30.55■■■□□ 2.48
PITX3-202ENST00000539804 CHMP3Q9Y3E7 222 aa30.55■■■□□ 2.48
PITX3-202ENST00000539804 RARSP54136 660 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
PITX3-202ENST00000539804 FAM161AQ3B820 660 aa30.54■■■□□ 2.48
PITX3-202ENST00000539804 APLP1P51693 650 aa30.53■■■□□ 2.48
PITX3-202ENST00000539804 TAF7LQ5H9L4 462 aa30.53■■■□□ 2.48
PITX3-202ENST00000539804 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
PITX3-202ENST00000539804 FOXO4P98177 505 aa30.52■■■□□ 2.48
PITX3-202ENST00000539804 LDHDQ86WU2 507 aa30.52■■■□□ 2.48
PITX3-202ENST00000539804 MINPP1Q9UNW1 487 aa30.52■■■□□ 2.48
PITX3-202ENST00000539804 LEMD3Q9Y2U8 911 aa30.52■■■□□ 2.48
PITX3-202ENST00000539804 DUOX1Q9NRD9 1551 aa30.52■■■□□ 2.48
PITX3-202ENST00000539804 EPHX2P34913 555 aa30.51■■■□□ 2.47
PITX3-202ENST00000539804 LMBR1LQ6UX01 489 aa30.51■■■□□ 2.47
PITX3-202ENST00000539804 SLC51AQ86UW1 340 aa30.51■■■□□ 2.47
PITX3-202ENST00000539804 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.47
PITX3-202ENST00000539804 CXCL9Q07325 125 aa30.5■■■□□ 2.47
PITX3-202ENST00000539804 LTBP1Q14766 1721 aa30.5■■■□□ 2.47
PITX3-202ENST00000539804 COL4A5P29400 1685 aa30.49■■■□□ 2.47
PITX3-202ENST00000539804 RIMBP2O15034 1052 aa30.49■■■□□ 2.47
PITX3-202ENST00000539804 CHADLQ6NUI6 762 aa30.49■■■□□ 2.47
PITX3-202ENST00000539804 ECE2O60344 883 aa30.47■■■□□ 2.47
PITX3-202ENST00000539804 MED23Q9ULK4 1368 aa30.46■■■□□ 2.47
PITX3-202ENST00000539804 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
PITX3-202ENST00000539804 RPS12P25398 132 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
PITX3-202ENST00000539804 KCNJ4P48050 445 aa30.46■■■□□ 2.47
PITX3-202ENST00000539804 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
PITX3-202ENST00000539804 PODNQ7Z5L7 613 aa30.46■■■□□ 2.47
PITX3-202ENST00000539804 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.47
PITX3-202ENST00000539804 DBNDD1Q9H9R9 158 aa30.45■■■□□ 2.47
PITX3-202ENST00000539804 COL4A1P02462 1669 aa30.45■■■□□ 2.46
PITX3-202ENST00000539804 RAD17O75943 681 aa30.44■■■□□ 2.46
PITX3-202ENST00000539804 DPF2Q92785 391 aa30.44■■■□□ 2.46
PITX3-202ENST00000539804 SUCLG2Q96I99 432 aa30.44■■■□□ 2.46
PITX3-202ENST00000539804 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
PITX3-202ENST00000539804 GPRC5DQ9NZD1 345 aa30.44■■■□□ 2.46
PITX3-202ENST00000539804 CLEC11AQ9Y240 323 aa30.44■■■□□ 2.46
PITX3-202ENST00000539804 SCNN1DP51172 638 aa30.43■■■□□ 2.46
PITX3-202ENST00000539804 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa30.43■■■□□ 2.46
PITX3-202ENST00000539804 USP44Q9H0E7 712 aa30.43■■■□□ 2.46
PITX3-202ENST00000539804 H7C1D1 291 aa30.42■■■□□ 2.46
PITX3-202ENST00000539804 CHRNDQ07001 517 aa30.42■■■□□ 2.46
PITX3-202ENST00000539804 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
PITX3-202ENST00000539804 CNNM1Q9NRU3 951 aa30.42■■■□□ 2.46
PITX3-202ENST00000539804 ZNF804BA4D1E1 1349 aa30.42■■■□□ 2.46
PITX3-202ENST00000539804 YDJCA8MPS7 323 aa30.41■■■□□ 2.46
PITX3-202ENST00000539804 DOK7Q18PE1 504 aa30.41■■■□□ 2.46
PITX3-202ENST00000539804 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
PITX3-202ENST00000539804 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
PITX3-202ENST00000539804 EPHA10Q5JZY3 1008 aa30.4■■■□□ 2.46
PITX3-202ENST00000539804 COA1Q9GZY4 146 aa30.4■■■□□ 2.46
PITX3-202ENST00000539804 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
PITX3-202ENST00000539804 SPEF2Q9C093 1822 aa30.4■■■□□ 2.46
PITX3-202ENST00000539804 PSMD14O00487 310 aa30.38■■■□□ 2.45
PITX3-202ENST00000539804 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa30.38■■■□□ 2.45
PITX3-202ENST00000539804 EPS15P42566 896 aa30.37■■■□□ 2.45
PITX3-202ENST00000539804 MMP14P50281 582 aa30.37■■■□□ 2.45
PITX3-202ENST00000539804 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
PITX3-202ENST00000539804 MROH5Q6ZUA9 1318 aa30.37■■■□□ 2.45
PITX3-202ENST00000539804 GNAI3P08754 354 aa30.36■■■□□ 2.45
PITX3-202ENST00000539804 VIL1P09327 827 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
PITX3-202ENST00000539804 AGBL3Q8NEM8 1001 aa30.36■■■□□ 2.45
PITX3-202ENST00000539804 KAZALD1Q96I82 304 aa30.36■■■□□ 2.45
PITX3-202ENST00000539804 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
PITX3-202ENST00000539804 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa30.35■■■□□ 2.45
PITX3-202ENST00000539804 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
PITX3-202ENST00000539804 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
PITX3-202ENST00000539804 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
PITX3-202ENST00000539804 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
PITX3-202ENST00000539804 ZNF609O15014 1411 aa30.34■■■□□ 2.45
PITX3-202ENST00000539804 MYO3BQ8WXR4 1341 aa30.34■■■□□ 2.45
PITX3-202ENST00000539804 USP17L3A6NCW0 530 aa30.34■■■□□ 2.45
PITX3-202ENST00000539804 USP17L4A6NCW7 530 aa30.34■■■□□ 2.45
PITX3-202ENST00000539804 USP17L1Q7RTZ2 530 aa30.34■■■□□ 2.45
PITX3-202ENST00000539804 ZNF804AQ7Z570 1209 aa30.32■■■□□ 2.44
PITX3-202ENST00000539804 ANKRD44Q8N8A2 993 aa30.32■■■□□ 2.44
PITX3-202ENST00000539804 FBXO3Q9UK99 471 aa30.32■■■□□ 2.44
PITX3-202ENST00000539804 BCAR3O75815 825 aa30.31■■■□□ 2.44
PITX3-202ENST00000539804 POTEIP0CG38 1075 aa30.31■■■□□ 2.44
PITX3-202ENST00000539804 POTEJP0CG39 1038 aa30.31■■■□□ 2.44
PITX3-202ENST00000539804 TRIM27P14373 513 aa30.31■■■□□ 2.44
PITX3-202ENST00000539804 UBE4AQ14139 1066 aa30.31■■■□□ 2.44
PITX3-202ENST00000539804 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
PITX3-202ENST00000539804 MICALL2Q8IY33 904 aa30.31■■■□□ 2.44
PITX3-202ENST00000539804 CNTROBQ8N137 903 aa30.31■■■□□ 2.44
PITX3-202ENST00000539804 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
PITX3-202ENST00000539804 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa30.31■■■□□ 2.44
PITX3-202ENST00000539804 STRIP1Q5VSL9 837 aa30.3■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 162 ms