RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368226.8

PTPRK-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 6,087 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-207ENST00000368226 ZSCAN12O43309 604 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 CETN2P41208 172 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 AMPD3Q01432 767 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 C19orf44Q9H6X5 657 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 TBCAO75347 108 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 CTNNA2P26232 953 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 SP4Q02446 784 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 TRIM47Q96LD4 638 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 EXOC1Q9NV70 894 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 FLT4P35916 1363 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 MAP3K5Q99683 1374 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 NPATQ14207 1427 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 NOP2P46087 812 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 RRAGBQ5VZM2 374 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 TPTE2Q6XPS3 522 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 FAM89AQ96GI7 184 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 MAP3K1Q13233 1512 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 A0A1W2PP64 1363 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 ANKRD44Q8N8A2 993 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 RNMTO43148 476 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 ADCY5O95622 1261 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 RLBP1P12271 317 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 ORAI2Q96SN7 254 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 PRAG1Q86YV5 1406 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 APOBRQ0VD83 1088 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 PLIN2Q99541 437 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 CARD14Q9BXL6 1004 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 CTAGE5O15320 804 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 STAT6P42226 847 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 AKNAD1Q5T1N1 836 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 GJA3Q9Y6H8 435 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 CCDC102BQ68D86 513 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 KLHDC4Q8TBB5 520 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 DYDC1Q8WWB3 177 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 NYXQ9GZU5 481 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 SYKP43405 635 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 UGGT2Q9NYU1 1516 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 ALDH1L1O75891 902 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 DRC1Q96MC2 740 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 TBC1D32Q96NH3 1257 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 KIF20AO95235 890 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 G2E3Q7L622 706 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 ZSCAN30Q86W11 494 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 RGS22Q8NE09 1264 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 CRACR2AQ9BSW2 395 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 PKD2L1Q9P0L9 805 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 ZNF165P49910 485 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 MAP3K19Q56UN5 1328 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 ZMYM3Q14202 1370 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 DPH6Q7L8W6 267 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 ITSN2Q9NZM3 1697 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 USO1O60763 962 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 EIF6P56537 245 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 CEP85Q6P2H3 762 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 ZBTB9Q96C00 473 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 DNAI2Q9GZS0 605 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 IFFO1Q0D2I5 559 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 CETN1Q12798 172 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 ARHGAP45Q92619 1136 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 TERF1P54274 439 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 DHX58Q96C10 678 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 FAM212AQ96EL1 285 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRK-207ENST00000368226 TNNI2P48788 182 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRK-207ENST00000368226 RBM25P49756 843 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PTPRK-207ENST00000368226 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PTPRK-207ENST00000368226 DCAF5Q96JK2 942 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRK-207ENST00000368226 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PTPRK-207ENST00000368226 CPA1P15085 419 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRK-207ENST00000368226 POLD1P28340 1107 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRK-207ENST00000368226 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PTPRK-207ENST00000368226 VAMP4O75379 141 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-207ENST00000368226 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-207ENST00000368226 TRAPPC3LQ5T215 181 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-207ENST00000368226 TMCO3Q6UWJ1 677 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-207ENST00000368226 PDCL2Q8N4E4 241 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-207ENST00000368226 CNNM2Q9H8M5 875 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-207ENST00000368226 CCDC66A2RUB6 948 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-207ENST00000368226 KIF18AQ8NI77 898 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-207ENST00000368226 N4BP3O15049 544 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-207ENST00000368226 DTNBO60941 627 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-207ENST00000368226 EZRP15311 586 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-207ENST00000368226 CCDC174Q6PII3 467 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-207ENST00000368226 LINS1Q8NG48 757 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-207ENST00000368226 MCM7P33993 719 aa14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.5 ms