RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467996.1

RNF13-208, Transcript of ring finger protein 13, human

TSL 5

Gene RNF13, Length 767 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF13-208	ENST00000467996	CRHBP	P24387	322 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	LAP3	P28838	519 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	CDA	P32320	146 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	OPRM1	P35372	400 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	SLC15A1	P46059	708 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	MTNR1A	P48039	350 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	ZNF84	P51523	738 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	CSNK2B	P67870	215 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	GLO1	Q04760	184 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	TMED1	Q13445	227 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	STK11	Q15831	433 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	SHF	Q7M4L6	423 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	FJX1	Q86VR8	437 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	ZNF511	Q8NB15	262 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	PRR7	Q8TB68	274 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	HTRA1	Q92743	480 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	RNFT2	Q96EX2	444 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	FOXB1	Q99853	325 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996		A0A1B0GUH1	482 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	SELENOF	O60613	162 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	SEC14L2	O76054	403 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	MPZL1	O95297	269 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	TF	P02787	698 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	SCG5	P05408	212 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	ITGA5	P08648	1049 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	IGHV1-2	P23083	117 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	MPG	P29372	298 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	CHN2	P52757	468 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	BLVRA	P53004	296 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	HSF2	Q03933	536 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	MEP1B	Q16820	701 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	OTP	Q5XKR4	325 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996		Q6ZT83	130 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	AHSA2	Q719I0	299 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	TIGD4	Q8IY51	512 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	GGH	Q92820	318 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	NABP1	Q96AH0	204 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	LGALS12	Q96DT0	336 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	CCDC120	Q96HB5	630 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	INTS14	Q96SY0	518 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	PIGM	Q9H3S5	423 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	MARCH7	Q9H992	704 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	POLE4	Q9NR33	117 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	SCN3B	Q9NY72	215 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	KALRN	O60229	2985 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	DVL2	O14641	736 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	MSTN	O14793	375 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	LRRTM2	O43300	516 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	TNFAIP8	O95379	198 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	HRG	P04196	525 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	SBK2	P0C263	348 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	PSKH1	P11801	424 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	B4GALT1	P15291	398 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	NPR2	P20594	1047 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	COX5A	P20674	150 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	MSR1	P21757	451 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	GABARAPL2	P60520	117 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	ADAM8	P78325	824 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	SLC35A2	P78381	396 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	RAB40B	Q12829	278 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNF13-208	ENST00000467996	POU4F2	Q12837	409 aa		10.41	□□□□□ -0.74

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 120.1 ms