RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 CPMP14384 443 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 FIGNL1Q6PIW4 674 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 USP53Q70EK8 1073 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 VN1R4Q7Z5H5 301 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 OR5T2Q8NGG2 359 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 DOK4Q8TEW6 326 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 LCN9Q8WX39 176 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 DNTTIP1Q9H147 329 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 IL21RQ9HBE5 538 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 MTFP1Q9UDX5 166 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa13.65□□□□□ -0.22
TOP3B-206ENST00000436282 PCP4L1A6NKN8 68 aa13.64□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 PLATP00750 562 aa13.64□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 ITPKBP27987 946 aa13.64□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 SLC35D3Q5M8T2 416 aa13.64□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa13.64□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 CDRT4Q8N9R6 151 aa13.64□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 OR6N1Q8NGY5 312 aa13.64□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa13.64□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 LRRC46Q96FV0 321 aa13.64□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 STACQ99469 402 aa13.64□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 PBX4Q9BYU1 374 aa13.64□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 TAS2R8Q9NYW2 309 aa13.64□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 H0Y8X5 98 aa13.64□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 CSF1P09603 554 aa13.64□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 LRRN1Q6UXK5 716 aa13.64□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 PTCHD1Q96NR3 888 aa13.64□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 TBC1D29Q9UFV1 150 aa13.64□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa13.64□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 MCIDASD6RGH6 385 aa13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 K7EQS6 105 aa13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 XRCC3O43542 346 aa13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 BRINP1O60477 761 aa13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 AK1P00568 194 aa13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 EGFP01133 1207 aa13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 UBBP0CG47 229 aa13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 SPI1P17947 270 aa13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 ADRA2CP18825 462 aa13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 UBA52P62987 128 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 SORDQ00796 357 aa13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 Q499Y3 187 aa13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM31Q5JXX7 168 aa13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 ENPP7Q6UWV6 458 aa13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 KRT77Q7Z794 578 aa13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 OR6K6Q8NGW6 343 aa13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 CCL4L1Q8NHW4 92 aa13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 PMM1Q92871 262 aa13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 FKRPQ9H9S5 495 aa13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM138Q9NPI0 162 aa13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 HPF1Q9NWY4 346 aa13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 DOCK8Q8NF50 2099 aa13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 GON4LQ3T8J9 2241 aa13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 RFPL4AA6NLU0 287 aa13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 PSMD9O00233 223 aa13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 CBX7O95931 251 aa13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 MST1P26927 711 aa13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 ADH7P40394 386 aa13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 ADPRHP54922 357 aa13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 LTBQ06643 244 aa13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM196Q5HYL7 178 aa13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 ALG10BQ5I7T1 473 aa13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 C11orf88Q6PI97 169 aa13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 NPEPL1Q8NDH3 523 aa13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 PLCL2Q9UPR0 1127 aa13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa13.63□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 FAM74A7A6NL05 159 aa13.62□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 MGMTP16455 207 aa13.62□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 FAM74A3Q4VXF1 159 aa13.62□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF684Q5T5D7 378 aa13.62□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 SLC6A19Q695T7 634 aa13.62□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 PAQR7Q86WK9 346 aa13.62□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 TMPRSS12Q86WS5 348 aa13.62□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 OR10K1Q8NGX5 313 aa13.62□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 ST8SIA2Q92186 375 aa13.62□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 NMNAT3Q96T66 252 aa13.62□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 RASL12Q9NYN1 266 aa13.62□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 A0A087WV62 115 aa13.62□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 PRR32B1ATL7 298 aa13.62□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 CD96P40200 585 aa13.62□□□□□ -0.23
TOP3B-206ENST00000436282 SCAND1P57086 179 aa13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.3 ms