RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 F5H6K3 240 aa2.38□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC31A2O15432 143 aa2.38□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PNMTP11086 282 aa2.38□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ABOP16442 354 aa2.38□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HNF1AP20823 631 aa2.38□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CMA1P23946 247 aa2.38□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GCAP28676 217 aa2.38□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPM6AP51674 278 aa2.38□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KLRC3Q07444 240 aa2.38□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GNMTQ14749 295 aa2.38□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 USH1GQ495M9 461 aa2.38□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LY6G6FQ5SQ64 297 aa2.38□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C1orf220Q5T0J3 134 aa2.38□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C1orf94Q6P1W5 598 aa2.38□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NLRP9Q7RTR0 991 aa2.38□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RNF182Q8N6D2 247 aa2.38□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SYT14Q8NB59 555 aa2.38□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC110Q8TBZ0 833 aa2.38□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZFP90Q8TF47 636 aa2.38□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OXGR1Q96P68 337 aa2.38□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CAPS2Q9BXY5 557 aa2.38□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RBKSQ9H477 322 aa2.38□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 POLE3Q9NRF9 147 aa2.38□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PCYOX1Q9UHG3 505 aa2.38□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HIVEP2P31629 2446 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C12orf71A8MTZ7 269 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A8MUI8 341 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AP2A1O95782 977 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TLX1NBP0CAT3 122 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GUCA2BQ16661 112 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ABCA11PQ4W5N1 156 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HSDL2Q6YN16 418 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PGAP1Q75T13 922 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC35F2Q8IXU6 374 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM86B1Q8N7N1 296 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF615Q8N8J6 731 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF709Q8N972 641 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FRZBQ92765 325 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FGF14Q92915 247 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RNF2Q99496 336 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RAB34Q9BZG1 259 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GLRX2Q9NS18 164 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MEMO1Q9Y316 297 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa2.37□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A1B0GWJ7 208 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HPGDP15428 266 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ACTA2P62736 377 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ACTC1P68032 377 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OXA1LQ15070 435 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SGCAQ16586 387 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF546Q86UE3 836 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TTC5Q8N0Z6 440 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC54Q8NEL0 328 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR1N2Q8NGR9 330 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR2G3Q8NGZ4 309 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TGM7Q96PF1 710 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 INPP5EQ9NRR6 644 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AURKCQ9UQB9 309 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WIF1Q9Y5W5 379 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COLCA2A8K830 154 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 B4GALT2O60909 372 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CTDNEP1O95476 244 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RHOXF2BP0C7M4 288 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TSPY4P0CV99 314 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TSPY10P0CW01 314 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EPB41P11171 864 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LAP3P28838 519 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GSSP48637 474 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CASP4P49662 377 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RGS4P49798 205 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPT1P50897 306 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HMGCS1Q01581 520 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPIBQ01892 262 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FZD2Q14332 565 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MESDQ14696 234 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UBE2SQ16763 222 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C10orf120Q5SQS8 335 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LCN12Q6JVE5 192 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ACTRT1Q8TDG2 376 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ING2Q9H160 280 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC40A1Q9NP59 571 aa2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.9 ms