RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 TRIB3Q96RU7 358 aa4.45□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 APOL2Q9BQE5 337 aa4.45□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 MED18Q9BUE0 208 aa4.45□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 FICDQ9BVA6 458 aa4.45□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 TRIM62Q9BVG3 475 aa4.45□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 ROGDIQ9GZN7 287 aa4.45□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 DPEP3Q9H4B8 488 aa4.45□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 IKZF5Q9H5V7 419 aa4.45□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 Q9H8V8 135 aa4.45□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 IL1RL2Q9HB29 575 aa4.45□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa4.45□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 FGF21Q9NSA1 209 aa4.45□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 MED9Q9NWA0 146 aa4.45□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 FLRT3Q9NZU0 649 aa4.45□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 SPASTQ9UBP0 616 aa4.45□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 PHF11Q9UIL8 331 aa4.45□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP4.45□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 SNX7Q9UNH6 387 aa4.45□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 TCF19Q9Y242 345 aa4.45□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 WDR83OSQ9Y284 106 aa4.45□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 TMED3Q9Y3Q3 217 aa4.45□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 GMPPBQ9Y5P6 360 aa4.45□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 ALPK3Q96L96 1907 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 ANKRD61A6NGH8 418 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 PMS2P5A8MQ11 134 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 CCRL2O00421 344 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 HCN1O60741 890 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 ECI2O75521 394 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 MFN2O95140 757 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 IGHV4-59P01825 116 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 C9P02748 559 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 MT-ND1P03886 318 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 FGF1P05230 155 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 LINC00032P0C843 101 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 GPX2P18283 190 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 HLA-DPA1P20036 260 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 CA6P23280 308 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 IL32P24001 234 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 ITGA3P26006 1051 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 FMO3P31513 532 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 CA5AP35218 305 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 SOX6P35712 828 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 CLK1P49759 484 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 STC1P52823 247 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 CLDN15P56746 228 aa4.44□□□□□ -1.7
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TRDN-204ENST00000542443 BTG1P62324 171 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 PSPHP78330 225 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 RPP38P78345 283 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
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TRDN-204ENST00000542443 IHHQ14623 411 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 CDKL4Q5MAI5 379 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 FBXL22Q6P050 247 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 ARMCX2Q7L311 632 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 IFNEQ86WN2 208 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 MMD2Q8IY49 270 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 FAM9CQ8IZT9 166 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 CLDN22Q8N7P3 220 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 OR5H6Q8NGV6 325 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 ZNF675Q8TD23 568 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 GIMAP1Q8WWP7 306 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 PDXPQ96GD0 296 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 C7orf34Q96L11 122 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 NEDD4LQ96PU5 975 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 KCNA7Q96RP8 456 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 MGME1Q9BQP7 344 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 MARVELD1Q9BSK0 173 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 COPS4Q9BT78 406 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 SLC22A4Q9H015 551 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 ISYNA1Q9NPH2 558 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 DYRK4Q9NR20 520 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 PLSCR3Q9NRY6 295 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 RGS18Q9NS28 235 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 NUDT4Q9NZJ9 180 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 OR12D3Q9UGF7 316 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 MUTYHQ9UIF7 546 aa4.44□□□□□ -1.7
TRDN-204ENST00000542443 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
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