RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, human

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRF-211	ENST00000467464	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		10.5	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		10.5	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		10.5	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		10.5	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		10.5	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		10.5	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		10.5	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	CIB4	A0PJX0	185 aa		10.49	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		10.49	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464		A8MVM7	634 aa		10.49	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	GPI	P06744	558 aa		10.49	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	UQCRB	P14927	111 aa		10.49	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	PTN	P21246	168 aa		10.49	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	CXCR1	P25024	350 aa		10.49	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	PTAFR	P25105	342 aa		10.49	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	CD40	P25942	277 aa		10.49	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	ACVR1B	P36896	505 aa		10.49	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF83	P51522	516 aa		10.49	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	FADD	Q13158	208 aa		10.49	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		10.49	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		10.49	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		10.49	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		10.49	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		10.49	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	CADM2	Q8N3J6	435 aa		10.49	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		10.49	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	SLC35B4	Q969S0	331 aa		10.49	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		10.49	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	PIF1	Q9H611	641 aa		10.49	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	IFT52	Q9Y366	437 aa		10.49	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		10.48	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464		A0A096LNT2	108 aa		10.48	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	INAFM1	C9JVW0	142 aa		10.48	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	RNF223	E7ERA6	249 aa		10.48	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	ARAF	P10398	606 aa		10.48	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	MPG	P29372	298 aa		10.48	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	LGALS3BP	Q08380	585 aa		10.48	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	ETFDH	Q16134	617 aa		10.48	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		10.48	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		10.48	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		10.48	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		10.48	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	LINGO2	Q7L985	606 aa		10.48	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		10.48	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	BBS10	Q8TAM1	723 aa		10.48	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	STK35	Q8TDR2	534 aa		10.48	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	RADIL	Q96JH8	1075 aa		10.48	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		10.48	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		10.48	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		10.48	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	VAPA	Q9P0L0	249 aa		10.48	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		10.48	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		10.48	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		10.48	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		10.48	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	ROS1	P08922	2347 aa		10.47	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	NR5A2	O00482	541 aa		10.47	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF432	O94892	652 aa		10.47	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	ETS2	P15036	469 aa		10.47	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	HTR2A	P28223	471 aa		10.47	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	PCSK6	P29122	969 aa		10.47	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	PRKAR1B	P31321	381 aa		10.47	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	TTK	P33981	857 aa		10.47	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	SELENOP	P49908	381 aa		10.47	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	ATP4B	P51164	291 aa		10.47	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	AQP5	P55064	265 aa		10.47	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	COPZ1	P61923	177 aa		10.47	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	VEZF1	Q14119	521 aa		10.47	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	ADRM1	Q16186	407 aa		10.47	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		10.47	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		10.47	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		10.47	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		10.47	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		10.47	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		10.47	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	NFKBID	Q8NI38	313 aa		10.47	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	SPDL1	Q96EA4	605 aa		10.47	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		10.47	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		10.47	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		10.47	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	REG4	Q9BYZ8	158 aa		10.47	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	NELFA	Q9H3P2	528 aa		10.47	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		10.47	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		10.47	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		10.47	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		10.47	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	UPB1	Q9UBR1	384 aa		10.47	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		10.47	□□□□□ -0.73
PTPRF-211	ENST00000467464	DSCAM	O60469	2012 aa		10.46	□□□□□ -0.73

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