RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486978.5

CTDSPL-208, Transcript of CTD small phosphatase like, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSPL, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL-208ENST00000486978 KLHL9Q9P2J3 617 aa5.7□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa5.7□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 DSPPQ9NZW4 1301 aa5.7□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 BIRC6Q9NR09 4857 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 A0A096LNT2 108 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 A0A096LPI6 279 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 A0A0G2JPF8 293 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 CDHR4A6H8M9 788 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 CFAP73A6NFT4 308 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 CLIC1O00299 241 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 NR5A2O00482 541 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 AP3D1O14617 1153 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 ST8SIA5O15466 376 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 DNPH1O43598 174 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 PMS2P2O95744 297 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 PLAUP00749 431 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 FESP07332 822 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 YES1P07947 543 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 THBS1P07996 1170 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 TFPTP0C1Z6 253 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 TFPIP10646 304 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 BMP2P12643 396 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 UQCRBP14927 111 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 CLK1P49759 484 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 MAP2K6P52564 334 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 EPS8Q12929 822 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 FADDQ13158 208 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 SQLEQ14534 574 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 RGNQ15493 299 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 ZSWIM7Q19AV6 140 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 AGKQ53H12 422 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 LRIF1Q5T3J3 769 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 C6orf52Q5T4I8 152 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 RNF220Q5VTB9 566 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 ANKRD34AQ69YU3 496 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF836Q6ZNA1 936 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 VRK2Q86Y07 508 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 ADGRG3Q86Y34 549 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 FUNDC1Q8IVP5 155 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF511Q8NB15 262 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 OR52P1PQ8NH57 321 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC38A5Q8WUX1 472 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 SPDL1Q96EA4 605 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 PIK3IP1Q96FE7 263 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 TMEM19Q96HH6 336 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 ARL5BQ96KC2 179 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 MAGEB18Q96M61 343 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 HDHD5Q9BXW7 423 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 ACTR6Q9GZN1 396 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 A4GALTQ9NPC4 353 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 CCDC167Q9P0B6 97 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 OSGIN1Q9UJX0 560 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 PRDM4Q9UKN5 801 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 GPR52Q9Y2T5 361 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF281Q9Y2X9 895 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 IFT52Q9Y366 437 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 TMED7Q9Y3B3 224 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa5.69□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa5.68□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 TMEM72A0PK05 275 aa5.68□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF724A8MTY0 619 aa5.68□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF208O43345 1280 aa5.68□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 EDF1O60869 148 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 NDUFS7O75251 213 aa5.68□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 SASH3O75995 380 aa5.68□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 TP53P04637 393 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 THBDP07204 575 aa5.68□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 GKN3PP0CG01 181 aa5.68□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 ARAFP10398 606 aa5.68□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 CCNA2P20248 432 aa5.68□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 PPIBP23284 216 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 IL32P24001 234 aa5.68□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 TACR3P29371 465 aa5.68□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 ACVR1BP36896 505 aa5.68□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC1A3P43003 542 aa5.68□□□□□ -1.5
CTDSPL-208ENST00000486978 OR3A2P47893 321 aa5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms