RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267970.8

TSPAN3-201, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSPAN3, Length 6,467 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-201ENST00000267970 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa15.68■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 NPC1O15118 1278 aa15.68■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 SCGB2A1O75556 95 aa15.68■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 APEX1P27695 318 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 AMIGO3Q86WK7 504 aa15.68■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 SGK3Q96BR1 496 aa15.68■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 NIT2Q9NQR4 276 aa15.68■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa15.68■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 PLA2G7Q13093 441 aa15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 PGGHGQ32M88 737 aa15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 ETFRF1Q6IPR1 90 aa15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 RFLNAQ6ZTI6 216 aa15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 SEC22CQ9BRL7 303 aa15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 OR11A1Q9GZK7 315 aa15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 HRASLSQ9HDD0 168 aa15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 KITLGP21583 273 aa15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 NTSR1P30989 418 aa15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 RING1Q06587 406 aa15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 SLC36A2Q495M3 483 aa15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 PXDC1Q5TGL8 231 aa15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 EMC10Q5UCC4 262 aa15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 ABHD17BQ5VST6 288 aa15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 SPIN2AQ99865 258 aa15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 APOOQ9BUR5 198 aa15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 BABAM2Q9NXR7 383 aa15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 B3GALT4O96024 378 aa15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 HRH2P25021 359 aa15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 KIAA1024LP59773 190 aa15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 SLC35B4Q969S0 331 aa15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 GPR78Q96P69 363 aa15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 OR5M11Q96RB7 305 aa15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 ZNF487B1APH4 448 aa15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 ERVFC1P60507 584 aa15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 CDKN3Q16667 212 aa15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 RANBP10Q6VN20 620 aa15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 ZNF454Q8N9F8 522 aa15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 OR2T11Q8NH01 316 aa15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 CHTF18Q8WVB6 975 aa15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 TXN2Q99757 166 aa15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 SGPP1Q9BX95 441 aa15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 GAB2Q9UQC2 676 aa15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 GCAP28676 217 aa15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 GDNFP39905 211 aa15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 CASP6P55212 293 aa15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 PHLDA2Q53GA4 152 aa15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 PGM2L1Q6PCE3 622 aa15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 OR5M1Q8NGP8 315 aa15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 ZNF416Q9BWM5 594 aa15.67■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 GLI4P10075 376 aa15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 UBA52P62987 128 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 RAB40BQ12829 278 aa15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 TCTE1Q5JU00 501 aa15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 CEBPBP17676 345 aa15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 RGRP47804 291 aa15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 SLC6A11P48066 632 aa15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP15.66■□□□□ 0.12e-6■■□□□ 11.7
TSPAN3-201ENST00000267970 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 SCD5Q86SK9 330 aa15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 CDRT4Q8N9R6 151 aa15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 TMEM82A0PJX8 343 aa15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 CDHR4A6H8M9 788 aa15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 EFSO43281 561 aa15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 XRCC3O43542 346 aa15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 G0S2P27469 103 aa15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 HCCSP53701 268 aa15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 CARD18P57730 90 aa15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 IKZF1Q13422 519 aa15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 FCN2Q15485 313 aa15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 COX20Q5RI15 118 aa15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 TMEM201Q5SNT2 666 aa15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 UNC5DQ6UXZ4 953 aa15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 MSTNO14793 375 aa15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 C5AR1P21730 350 aa15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 TAS2R19P59542 299 aa15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 NKAIN2Q5VXU1 208 aa15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 FAM111BQ6SJ93 734 aa15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 KDELC1Q6UW63 502 aa15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 SSX7Q7RTT5 188 aa15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 FAM58AQ8N1B3 248 aa15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 OR13C9Q8NGT0 318 aa15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 RNF128Q8TEB7 428 aa15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 UQCC2Q9BRT2 126 aa15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 PELI2Q9HAT8 420 aa15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 PCDHB10Q9UN67 800 aa15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 ZFP92A6NM28 416 aa15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 ITGAMP11215 1152 aa15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 NUDT1P36639 197 aa15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 ZNF425Q6IV72 752 aa15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 ZNF852Q6ZMS4 543 aa15.66■□□□□ 0.1
TSPAN3-201ENST00000267970 OR51D1Q8NGF3 324 aa15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 331 ms