RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480525.5

HDAC6-223, Transcript of histone deacetylase 6, human

TSL 3

Gene HDAC6, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC6-223	ENST00000480525	LIPE	Q05469	1076 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	TFF3	Q07654	80 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	DMTN	Q08495	405 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	BNIP1	Q12981	228 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	DGCR6	Q14129	220 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	SELPLG	Q14242	412 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	P2RY6	Q15077	328 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	NPTX1	Q15818	432 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	DUSP7	Q16829	419 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	DCST1	Q5T197	706 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	HBM	Q6B0K9	141 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	VRK2	Q86Y07	508 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	KIF18B	Q86Y91	864 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	ZNF614	Q8N883	585 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	OR10D3	Q8NH80	312 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	ZNF563	Q8TA94	476 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	PRR7	Q8TB68	274 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	PRRC1	Q96M27	445 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	FAM107B	Q9H098	131 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	EMC3	Q9P0I2	261 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	MALT1	Q9UDY8	824 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	TINAG	Q9UJW2	476 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	RCE1	Q9Y256	329 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	RASD1	Q9Y272	281 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	VDAC3	Q9Y277	283 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	ITPR2	Q14571	2701 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525		A0A0G2JNJ9	132 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525		A0A0J9YW62	118 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525		A0A1B0GWA3	101 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	LIPT2	A6NK58	231 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	AQP12B	A6NM10	295 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	ZNF716	A6NP11	495 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525		A8MXE2	369 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525		H3BML4	177 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	SULT2B1	O00204	365 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	AP3D1	O14617	1153 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	OIP5	O43482	229 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	FRS3	O43559	492 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	TPST1	O60507	370 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	TMCC2	O75069	709 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	SEMA7A	O75326	666 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	KRT36	O76013	467 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	PRKD3	O94806	890 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	TOX	O94900	526 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	PRSS23	O95084	383 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	SYNGR4	O95473	234 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	CGA	P01215	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	C1QC	P02747	245 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	IFNW1	P05000	195 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	YES1	P07947	543 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	NPIPA8	P0DM63	369 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	NR2C1	P13056	603 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	RHCE	P18577	417 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	ENPP1	P22413	925 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	CXCR1	P25024	350 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	HTR2A	P28223	471 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	TACR3	P29371	465 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	IDUA	P35475	653 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	SLC9A3	P48764	834 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	DIO1	P49895	249 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	CTBP2	P56545	445 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	CLDN20	P56880	219 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	NUP107	P57740	925 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	HSF1	Q00613	529 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	EGR4	Q05215	589 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	ST3GAL3	Q11203	375 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	ZP4	Q12836	540 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	MYBPH	Q13203	477 aa		4.55	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.4 ms