RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618613.5

RPL17-223, Transcript of ribosomal protein L17, human

APPRIS P1 TSL 3

Gene RPL17, Length 856 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL17-223	ENST00000618613	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		14.94	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		14.94	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		14.94	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	POLE3	Q9NRF9	147 aa		14.94	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	AIG1	Q9NVV5	245 aa		14.94	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		14.94	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		14.94	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	WDR45	Q9Y484	360 aa		14.94	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613		E9PBE3	544 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	HEXA	P06865	529 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	PGC	P20142	388 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	NTF4	P34130	210 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	CDKN2C	P42773	168 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	DIO1	P49895	249 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	NME5	P56597	212 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	CHRNE	Q04844	493 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	ITGAD	Q13349	1161 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	SYT14P1	Q58G82	188 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613		Q6ZT83	130 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	14.93	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	ARL5B	Q96KC2	179 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	INPP5K	Q9BT40	448 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	SLC38A1	Q9H2H9	487 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	CENPH	Q9H3R5	247 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	DPRX	A6NFQ7	191 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	ZNF724	A8MTY0	619 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	AGR2	O95994	175 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	FES	P07332	822 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	CHRM4	P08173	479 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	IL32	P24001	234 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	S100A3	P33764	101 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	KHK	P50053	298 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	P2RY6	Q15077	328 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	SYPL1	Q16563	259 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	RNF130	Q86XS8	419 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	ANKFN1	Q8N957	763 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	TMEM234	Q8WY98	164 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	BDH2	Q9BUT1	245 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	CCDC154	A6NI56	674 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	ZNF716	A6NP11	495 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	OVOL3	O00110	214 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	AP3D1	O14617	1153 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	RAMP1	O60894	148 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	LYZL6	O75951	148 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	DANCR	P0C864	163 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	COX5A	P20674	150 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	IGHV1-2	P23083	117 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	RYK	P34925	604 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	KCNJ10	P78508	379 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	MAPK11	Q15759	364 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	COX20	Q5RI15	118 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	HSD17B8	Q92506	261 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		14.9	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		14.9	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		14.9	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	SULT2B1	O00204	365 aa		14.9	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	GSN	P06396	782 aa		14.9	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	SOD3	P08294	240 aa		14.9	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	EPHA3	P29320	983 aa		14.9	□□□□□ -0.02
RPL17-223	ENST00000618613	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02

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