RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467128.5

USP34-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 4

Gene USP34, Length 531 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-208	ENST00000467128	HTR3A	P46098	478 aa		7.53	□□□□□ -1.2
USP34-208	ENST00000467128	CASP9	P55211	416 aa		7.53	□□□□□ -1.2
USP34-208	ENST00000467128	TFF3	Q07654	80 aa		7.53	□□□□□ -1.2
USP34-208	ENST00000467128	FOXF1	Q12946	379 aa		7.53	□□□□□ -1.2
USP34-208	ENST00000467128	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
USP34-208	ENST00000467128	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
USP34-208	ENST00000467128	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		7.53	□□□□□ -1.2
USP34-208	ENST00000467128	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		7.53	□□□□□ -1.2
USP34-208	ENST00000467128	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
USP34-208	ENST00000467128	SERPINA11	Q86U17	422 aa		7.53	□□□□□ -1.2
USP34-208	ENST00000467128	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		7.53	□□□□□ -1.2
USP34-208	ENST00000467128	GATS	Q8NAP1	163 aa		7.53	□□□□□ -1.2
USP34-208	ENST00000467128	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		7.53	□□□□□ -1.2
USP34-208	ENST00000467128	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
USP34-208	ENST00000467128	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
USP34-208	ENST00000467128	TMEM19	Q96HH6	336 aa		7.53	□□□□□ -1.2
USP34-208	ENST00000467128	RNF145	Q96MT1	663 aa		7.53	□□□□□ -1.2
USP34-208	ENST00000467128	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		7.53	□□□□□ -1.2
USP34-208	ENST00000467128	SH3GL1	Q99961	368 aa		7.53	□□□□□ -1.2
USP34-208	ENST00000467128	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		7.53	□□□□□ -1.2
USP34-208	ENST00000467128	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
USP34-208	ENST00000467128	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		7.53	□□□□□ -1.2
USP34-208	ENST00000467128	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		7.53	□□□□□ -1.2
USP34-208	ENST00000467128	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
USP34-208	ENST00000467128	GP6	Q9HCN6	339 aa		7.53	□□□□□ -1.2
USP34-208	ENST00000467128	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		7.53	□□□□□ -1.2
USP34-208	ENST00000467128		Q9UFV3	132 aa		7.53	□□□□□ -1.2
USP34-208	ENST00000467128	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
USP34-208	ENST00000467128	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
USP34-208	ENST00000467128	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		7.53	□□□□□ -1.2
USP34-208	ENST00000467128	RNF114	Q9Y508	228 aa		7.53	□□□□□ -1.2
USP34-208	ENST00000467128	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
USP34-208	ENST00000467128	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		7.53	□□□□□ -1.2
USP34-208	ENST00000467128	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
USP34-208	ENST00000467128	HCFC1	P51610	2035 aa		7.52	□□□□□ -1.2
USP34-208	ENST00000467128	SLC22A20	A6NK97	555 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	C5orf58	C9J3I9	102 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	PRSS44	E7EML9	344 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	DNPH1	O43598	174 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	SNX3	O60493	162 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	PGM3	O95394	542 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	CTSS	P25774	331 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	HTR1E	P28566	365 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	PRKAR1B	P31321	381 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	ASCL1	P50553	236 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	CLDN15	P56746	228 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	KLF10	Q13118	480 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	NFYC	Q13952	458 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	QPRT	Q15274	297 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	GUSBP1	Q15486	140 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	REEP3	Q6NUK4	255 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	GRINA	Q7Z429	371 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	SPATA21	Q7Z572	469 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	KRT73	Q86Y46	540 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	NAXE	Q8NCW5	288 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	HIPK4	Q8NE63	616 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	POC1B	Q8TC44	478 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	ZG16B	Q96DA0	208 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	LRRC46	Q96FV0	321 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	KLHL15	Q96M94	604 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	TRIB1	Q96RU8	372 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	PIGM	Q9H3S5	423 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	RNF122	Q9H9V4	155 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	GLRX2	Q9NS18	164 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	ACER3	Q9NUN7	267 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	JKAMP	Q9P055	326 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		7.52	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128		A1L4Q6	167 aa		7.51	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	GMNC	A6NCL1	334 aa		7.51	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		7.51	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	CFAP73	A6NFT4	308 aa		7.51	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	FXYD1	O00168	92 aa		7.51	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	FBP2	O00757	339 aa		7.51	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	SEC14L5	O43304	696 aa		7.51	□□□□□ -1.21

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