RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436289.6

NELFE-204, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5

Gene NELFE, Length 906 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-204ENST00000436289 CLEC2AQ6UVW9 174 aa13.45□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 PDPRQ8NCN5 879 aa13.45□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 ELOA3Q8NG57 546 aa13.45□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 HUS1BQ8NHY5 278 aa13.45□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 SLC35A4Q96G79 324 aa13.45□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 NTMT1Q9BV86 223 aa13.45□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa13.45□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 CD274Q9NZQ7 290 aa13.45□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 EXPH5Q8NEV8 1989 aa13.45□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 FREM1Q5H8C1 2179 aa13.44□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 A0A096LNT2 108 aa13.44□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa13.44□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 FAM234BA2RU67 622 aa13.44□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 CLOCKO15516 846 aa13.44□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 SSX4O60224 188 aa13.44□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 TMPRSS11DO60235 418 aa13.44□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 CPMP14384 443 aa13.44□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 EPORP19235 508 aa13.44□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 HNF1AP20823 631 aa13.44□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 GRK2P25098 689 aa13.44□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 CLDN15P56746 228 aa13.44□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 SGCBQ16585 318 aa13.44□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 GRHL2Q6ISB3 625 aa13.44□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 BHLHB9Q6PI77 547 aa13.44□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 NUDT13Q86X67 352 aa13.44□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 METTL25Q8N6Q8 603 aa13.44□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 OR4K17Q8NGC6 315 aa13.44□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa13.44□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 HSD17B8Q92506 261 aa13.44□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 ESAMQ96AP7 390 aa13.44□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 DESI2Q9BSY9 194 aa13.44□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 PRRG4Q9BZD6 226 aa13.44□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 SDHAF3Q9NRP4 125 aa13.44□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 BCAP29Q9UHQ4 241 aa13.44□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 AP4B1Q9Y6B7 739 aa13.44□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa13.43□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 GOLGA6L10A6NI86 522 aa13.43□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 PGRMC2O15173 223 aa13.43□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 EEDO75530 441 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 REM1O75628 298 aa13.43□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 BSGP35613 385 aa13.43□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 KRT20P35900 424 aa13.43□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 NUDT6P53370 316 aa13.43□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 PGGHGQ32M88 737 aa13.43□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 LIPJQ5W064 366 aa13.43□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 DESI1Q6ICB0 168 aa13.43□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 SSX8Q7RTT4 187 aa13.43□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 ALPK2Q86TB3 2170 aa13.43□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 DTX2Q86UW9 622 aa13.43□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 ADCY4Q8NFM4 1077 aa13.43□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 GRK7Q8WTQ7 553 aa13.43□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 PROX1Q92786 737 aa13.43□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 ITPAQ9BY32 194 aa13.43□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 PTGES2Q9H7Z7 377 aa13.43□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa13.43□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 SLC17A6Q9P2U8 582 aa13.43□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 ZNF337Q9Y3M9 751 aa13.43□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 MGAM2Q2M2H8 2515 aa13.42□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 GUCY1B2O75343 617 aa13.42□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 ATP1B1P05026 303 aa13.42□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 ADH6P28332 368 aa13.42□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 GZMKP49863 264 aa13.42□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 POU4F1Q01851 419 aa13.42□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 FAPQ12884 760 aa13.42□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 ZNF460Q14592 562 aa13.42□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 NNATQ16517 81 aa13.42□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa13.42□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 AGAP6Q5VW22 663 aa13.42□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 RAET1LQ5VY80 246 aa13.42□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa13.42□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 OR5M10Q6IEU7 315 aa13.42□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 TTC27Q6P3X3 843 aa13.42□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 C12orf54Q6X4T0 127 aa13.42□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa13.42□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 LRRC39Q96DD0 335 aa13.42□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 TSPAN17Q96FV3 270 aa13.42□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 ZNF639Q9UID6 485 aa13.42□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 PSME2Q9UL46 239 aa13.42□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 KCNS2Q9ULS6 477 aa13.42□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
NELFE-204ENST00000436289 H0YIV9 168 aa13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 95.8 ms