RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373779.7

PTPRU-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-202ENST00000373779 C17orf62Q9BQA9 187 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 BTNL2Q9UIR0 455 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 GGT2P36268 569 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 MANEALQ5VSG8 457 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 POMZP3Q6PJE2 187 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 Q8N402 240 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 CHPT1Q8WUD6 406 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 ACOT13Q9NPJ3 140 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 SLX4Q8IY92 1834 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 TMEM88BA6NKF7 163 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 GPR39O43194 453 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 ARL6IP5O75915 188 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 GRK6P43250 576 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 FAM180AQ6UWF9 173 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 TEX26Q8N6G2 289 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 PSD4Q8NDX1 1056 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 CCDC115Q96NT0 180 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 EXTL2Q9UBQ6 330 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 GLOD5A6NK44 160 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 UGDHO60701 494 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 LRR1Q96L50 414 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 HCN2Q9UL51 889 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 BAIAP2Q9UQB8 552 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 SLC35F4A4IF30 521 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 H7BY64 318 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 PFKLP17858 780 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 GJA5P36382 358 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 TEAD2Q15562 447 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 C6orf120Q7Z4R8 191 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP16.68■□□□□ 0.267e-11■■■■□ 21.8
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF583Q96ND8 569 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 PRAP1Q96NZ9 151 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 SARDHQ9UL12 918 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 SLC31A1O15431 190 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 EDNRAP25101 427 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 KCNC1P48547 511 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 RPL34P49207 117 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 DESI1Q6ICB0 168 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF354BQ96LW1 612 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 SPEF1Q9Y4P9 236 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 RAB8AP61006 207 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 CNKSR3Q6P9H4 555 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 NXPE4Q6UWF7 544 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 PRSS21Q9Y6M0 314 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 CLDN4O14493 209 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 ITGA10O75578 1167 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 BMP8BP34820 402 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 TAS2R43P59537 309 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 GSTM4Q03013 218 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 Q6ZNX1 250 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 COMMD6Q7Z4G1 85 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 C16orf78Q8WTQ4 265 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 GATAD2BQ8WXI9 593 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 IRF7Q92985 503 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 TESCQ96BS2 214 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 MCHR1Q99705 422 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 BACE2Q9Y5Z0 518 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 COL4A1P02462 1669 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF879B4DU55 563 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 NUAK1O60285 661 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 MT-ND5P03915 603 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 HRH2P25021 359 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 CA5AP35218 305 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 OR52E4Q8NGH9 312 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 OR51G2Q8NGK0 314 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 MOAP1Q96BY2 351 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 LGR4Q9BXB1 951 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 OR51E2Q9H255 320 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 GJD2Q9UKL4 321 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 MUSKO15146 869 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 C1orf216Q8TAB5 229 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 SRRDQ9UH36 339 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 PHIPQ8WWQ0 1821 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 CDK1P06493 297 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 SNX29P2Q8IUI4 249 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 SLC22A18Q96BI1 424 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 BRF2Q9HAW0 419 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 UPB1Q9UBR1 384 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 HTR3EA5X5Y0 456 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 KMOO15229 486 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 OSMP13725 252 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 CD70P32970 193 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 GNG2P59768 71 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 AKIRIN2Q53H80 203 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 CES4AQ5XG92 561 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 RFT1Q96AA3 541 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 RNF31Q96EP0 1072 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-202ENST00000373779 ANHXE9PGG2 379 aa16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms