RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 F2RL3Q96RI0 385 aa17.25■□□□□ 0.35
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PTX4-201ENST00000293922 SIRT5Q9NXA8 310 aa17.25■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 GIMAP2Q9UG22 337 aa17.25■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa17.25■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
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PTX4-201ENST00000293922 TXNDC9O14530 226 aa17.24■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 CEACAM4O75871 244 aa17.24■□□□□ 0.35
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PTX4-201ENST00000293922 COLEC12Q5KU26 742 aa17.24■□□□□ 0.35
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PTX4-201ENST00000293922 OVCH1Q7RTY7 1134 aa17.24■□□□□ 0.35
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PTX4-201ENST00000293922 ANKS4BQ8N8V4 417 aa17.24■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
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PTX4-201ENST00000293922 MACROD1Q9BQ69 325 aa17.24■□□□□ 0.35
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PTX4-201ENST00000293922 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
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PTX4-201ENST00000293922 SLC26A1Q9H2B4 701 aa17.23■□□□□ 0.35
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PTX4-201ENST00000293922 KCNC2Q96PR1 638 aa17.22■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 SPSB2Q99619 263 aa17.22■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 WDR54Q9H977 334 aa17.22■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 ASIC5Q9NY37 505 aa17.22■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 HEY2Q9UBP5 337 aa17.22■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 CTSFQ9UBX1 484 aa17.22■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 TRIM33Q9UPN9 1127 aa17.22■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
PTX4-201ENST00000293922 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
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