RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-222ENST00000635152 MRE11P49959 708 aa15.98■□□□□ 0.15
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BRF1-222ENST00000635152 STAP2Q9UGK3 403 aa15.98■□□□□ 0.15
BRF1-222ENST00000635152 NUCB2P80303 420 aa15.98■□□□□ 0.15
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BRF1-222ENST00000635152 HSPA4P34932 840 aa15.87■□□□□ 0.13
BRF1-222ENST00000635152 C19orf44Q9H6X5 657 aa15.87■□□□□ 0.13
BRF1-222ENST00000635152 HYPKQ9NX55 129 aa15.87■□□□□ 0.13
BRF1-222ENST00000635152 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
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BRF1-222ENST00000635152 SIL1Q9H173 461 aa15.87■□□□□ 0.13
BRF1-222ENST00000635152 KDM3BQ7LBC6 1761 aa15.87■□□□□ 0.13
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BRF1-222ENST00000635152 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
BRF1-222ENST00000635152 GRM8O00222 908 aa15.86■□□□□ 0.13
BRF1-222ENST00000635152 AACSQ86V21 672 aa15.86■□□□□ 0.13
BRF1-222ENST00000635152 RASEFQ8IZ41 740 aa15.86■□□□□ 0.13
BRF1-222ENST00000635152 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
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BRF1-222ENST00000635152 KLHDC4Q8TBB5 520 aa15.85■□□□□ 0.13
BRF1-222ENST00000635152 GPT2Q8TD30 523 aa15.85■□□□□ 0.13
BRF1-222ENST00000635152 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP15.85■□□□□ 0.13
BRF1-222ENST00000635152 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa15.85■□□□□ 0.13
BRF1-222ENST00000635152 DDX58O95786 925 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
BRF1-222ENST00000635152 CPA1P15085 419 aa15.85■□□□□ 0.13
BRF1-222ENST00000635152 MTX1Q13505 466 aa15.85■□□□□ 0.13
BRF1-222ENST00000635152 CUL4AQ13619 759 aa15.85■□□□□ 0.13
BRF1-222ENST00000635152 PDIA6Q15084 440 aa15.85■□□□□ 0.13
BRF1-222ENST00000635152 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa15.85■□□□□ 0.13
BRF1-222ENST00000635152 LINS1Q8NG48 757 aa15.85■□□□□ 0.13
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