RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411660.1

RPS3AP25-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 25, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP25, Length 793 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP25-201ENST00000411660 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa10.49□□□□□ -0.73
RPS3AP25-201ENST00000411660 RASA1P20936 1047 aa10.48□□□□□ -0.73
RPS3AP25-201ENST00000411660 EFHC2Q5JST6 749 aa10.48□□□□□ -0.73
RPS3AP25-201ENST00000411660 SLC9A9Q8IVB4 645 aa10.48□□□□□ -0.73
RPS3AP25-201ENST00000411660 NDFIP2Q9NV92 336 aa10.48□□□□□ -0.73
RPS3AP25-201ENST00000411660 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
RPS3AP25-201ENST00000411660 CFAP70Q5T0N1 1121 aa10.47□□□□□ -0.73
RPS3AP25-201ENST00000411660 NLRP8Q86W28 1048 aa10.47□□□□□ -0.73
RPS3AP25-201ENST00000411660 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
RPS3AP25-201ENST00000411660 IGF1RP08069 1367 aa10.47□□□□□ -0.73
RPS3AP25-201ENST00000411660 SFI1A8K8P3 1242 aa10.46□□□□□ -0.73
RPS3AP25-201ENST00000411660 ARHGEF15O94989 841 aa10.46□□□□□ -0.73
RPS3AP25-201ENST00000411660 NOS2P35228 1153 aa10.46□□□□□ -0.73
RPS3AP25-201ENST00000411660 PTK7Q13308 1070 aa10.46□□□□□ -0.73
RPS3AP25-201ENST00000411660 NBPF1Q3BBV0 1214 aa10.46□□□□□ -0.73
RPS3AP25-201ENST00000411660 LYPD4Q6UWN0 246 aa10.46□□□□□ -0.73
RPS3AP25-201ENST00000411660 L3MBTL2Q969R5 705 aa10.46□□□□□ -0.73
RPS3AP25-201ENST00000411660 PARP3Q9Y6F1 533 aa10.46□□□□□ -0.73
RPS3AP25-201ENST00000411660 MX2P20592 715 aa10.45□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 TBCELQ5QJ74 424 aa10.45□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 POTEAQ6S8J7 498 aa10.45□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 C7orf43Q8WVR3 580 aa10.45□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 ZIC5Q96T25 663 aa10.45□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 VRTNQ9H8Y1 702 aa10.45□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 PHF24Q9UPV7 400 aa10.45□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 A0A1W2PNR3 127 aa10.44□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 BNIP3LO60238 219 aa10.44□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 TXLNAP40222 546 aa10.44□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 FAM196BA6NMK8 535 aa10.43□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 TATP17735 454 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 SEC13P55735 322 aa10.43□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 FIGNL1Q6PIW4 674 aa10.43□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 ADAMTS8Q9UP79 889 aa10.43□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa10.43□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 EML1O00423 815 aa10.42□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 SVOPQ8N4V2 548 aa10.42□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 SERTM1A2A2V5 107 aa10.41□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 USP17L15C9J2P7 530 aa10.41□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 USP17L10C9JJH3 530 aa10.41□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 USP17L13C9JLJ4 530 aa10.41□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 USP17L12C9JPN9 530 aa10.41□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 USP17L11C9JVI0 530 aa10.41□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 USP17L21D6R901 530 aa10.41□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 USP17L18D6R9N7 530 aa10.41□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 USP17L22D6RA61 530 aa10.41□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 USP17L17D6RBQ6 530 aa10.41□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 USP17L19D6RCP7 530 aa10.41□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 USP17L20D6RJB6 530 aa10.41□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 C21orf2O43822 256 aa10.41□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 USP17L24Q0WX57 530 aa10.41□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 DPYDQ12882 1025 aa10.41□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 ACDQ96AP0 544 aa10.41□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 ABHD17AQ96GS6 310 aa10.41□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 MAP2K3P46734 347 aa10.4□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa10.4□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 ANKMY2Q8IV38 441 aa10.4□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 ARXQ96QS3 562 aa10.4□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 HCN2Q9UL51 889 aa10.4□□□□□ -0.74
RPS3AP25-201ENST00000411660 ATAD2Q6PL18 1390 aa10.39□□□□□ -0.75
RPS3AP25-201ENST00000411660 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
RPS3AP25-201ENST00000411660 SAMD5Q5TGI4 173 aa10.39□□□□□ -0.75
RPS3AP25-201ENST00000411660 STAG2Q8N3U4 1231 aa10.39□□□□□ -0.75
RPS3AP25-201ENST00000411660 GAS2L2Q8NHY3 880 aa10.39□□□□□ -0.75
RPS3AP25-201ENST00000411660 ZNF232Q9UNY5 417 aa10.39□□□□□ -0.75
RPS3AP25-201ENST00000411660 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
RPS3AP25-201ENST00000411660 C2CD2LO14523 706 aa10.38□□□□□ -0.75
RPS3AP25-201ENST00000411660 FGFR3P22607 806 aa10.38□□□□□ -0.75
RPS3AP25-201ENST00000411660 CTBSQ01459 385 aa10.38□□□□□ -0.75
RPS3AP25-201ENST00000411660 TNP2Q05952 138 aa10.38□□□□□ -0.75
RPS3AP25-201ENST00000411660 C1orf53Q5VUE5 145 aa10.38□□□□□ -0.75
RPS3AP25-201ENST00000411660 KLRG1Q96E93 195 aa10.38□□□□□ -0.75
RPS3AP25-201ENST00000411660 LRRC4BQ9NT99 713 aa10.38□□□□□ -0.75
RPS3AP25-201ENST00000411660 BCRP11274 1271 aa10.37□□□□□ -0.75
RPS3AP25-201ENST00000411660 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
RPS3AP25-201ENST00000411660 BICDL1Q6ZP65 573 aa10.37□□□□□ -0.75
RPS3AP25-201ENST00000411660 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
RPS3AP25-201ENST00000411660 FAM157BP0CG42 384 aa10.36□□□□□ -0.75
RPS3AP25-201ENST00000411660 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
RPS3AP25-201ENST00000411660 MAPTP10636 758 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
RPS3AP25-201ENST00000411660 MAP3K10Q02779 954 aa10.35□□□□□ -0.75
RPS3AP25-201ENST00000411660 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
RPS3AP25-201ENST00000411660 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
RPS3AP25-201ENST00000411660 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa10.35□□□□□ -0.75
RPS3AP25-201ENST00000411660 OIP5O43482 229 aa10.34□□□□□ -0.75
RPS3AP25-201ENST00000411660 RFX1P22670 979 aa10.34□□□□□ -0.75
RPS3AP25-201ENST00000411660 KCNMA1Q12791 1236 aa10.34□□□□□ -0.75
RPS3AP25-201ENST00000411660 CDCA8Q53HL2 280 aa10.34□□□□□ -0.75
RPS3AP25-201ENST00000411660 FAM182BQ5T319 152 aa10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms