RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tnks1bp1P58871 1720 aa25.73■■□□□ 1.71
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Stk11ipQ3TAA7 1072 aa25.71■■□□□ 1.71
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Exoc6bA6H5Z3 810 aa25.71■■□□□ 1.71
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cct4P80315 539 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bcl9lQ67FY2 1494 aa25.71■■□□□ 1.71
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tpx2A2APB8 745 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tlr7P58681 1050 aa25.7■■□□□ 1.7
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Isy1Q69ZQ2 285 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccdc155Q80VJ8 648 aa25.7■■□□□ 1.7
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bloc1s4Q8VED2 215 aa25.7■■□□□ 1.7
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zranb3Q6NZP1 1069 aa25.7■■□□□ 1.7
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MccE9PWI3 1003 aa25.69■■□□□ 1.7
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 DccP70211 1447 aa25.69■■□□□ 1.7
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 GckrQ91X44 587 aa25.69■■□□□ 1.7
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tns2Q8CGB6 1400 aa25.68■■□□□ 1.7
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hsp90b1P08113 802 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Anapc15P60007 132 aa25.68■■□□□ 1.7
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bag4Q8CI61 457 aa25.68■■□□□ 1.7
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Eif3aP23116 1344 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mphosph10Q810V0 681 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cfdp1O88271 295 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 LlphQ9D945 130 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Phkg2Q9DB30 406 aa25.67■■□□□ 1.7
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bcl2l13P59017 434 aa25.66■■□□□ 1.7
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ubr2Q6WKZ8 1755 aa25.66■■□□□ 1.7
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slit1Q80TR4 1531 aa25.66■■□□□ 1.7
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Map3k2Q61083 619 aa25.65■■□□□ 1.7
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AnlnQ8K298 1121 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tceal9Q9DD24 104 aa25.65■■□□□ 1.7
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Unc5clQ6R653 518 aa25.64■■□□□ 1.7
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Chmp7Q8R1T1 451 aa25.64■■□□□ 1.7
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PtmsQ9D0J8 101 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Taf7Q9R1C0 341 aa25.64■■□□□ 1.7
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc4a10Q5DTL9 1118 aa25.64■■□□□ 1.69
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 RgmbQ7TQ33 436 aa25.64■■□□□ 1.69
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp142G5E869 1843 aa25.64■■□□□ 1.69
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tjp1P39447 1745 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vwa3bJ9JI28 736 aa25.63■■□□□ 1.69
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Brinp3Q499E0 766 aa25.63■■□□□ 1.69
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 HellsQ60848 821 aa25.63■■□□□ 1.69
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ddx60E9PZQ1 1711 aa25.63■■□□□ 1.69
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam50bQ9WTJ8 334 aa25.63■■□□□ 1.69
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Irf9Q61179 399 aa25.62■■□□□ 1.69
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mum1Q6DID5 682 aa25.62■■□□□ 1.69
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SympkQ80X82 1284 aa25.61■■□□□ 1.69
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dnttip2Q8R2M2 758 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 DekQ7TNV0 380 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Abcc4E9Q236 1325 aa25.6■■□□□ 1.69
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rasa1E9PYG6 1038 aa25.6■■□□□ 1.69
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PrkcshO08795 521 aa25.6■■□□□ 1.69
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 NexnQ7TPW1 607 aa25.6■■□□□ 1.69
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Map3k13Q1HKZ5 959 aa25.59■■□□□ 1.69
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tgfb1i1Q62219 461 aa25.58■■□□□ 1.69
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 4930572O03RikQ8C5Y0 211 aa25.58■■□□□ 1.69
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pmfbp1Q9WVQ0 1022 aa25.58■■□□□ 1.69
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pdia6Q922R8 440 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.68
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Asic4Q7TNS7 539 aa25.57■■□□□ 1.68
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cadps2Q8BYR5 1297 aa25.57■■□□□ 1.68
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Shank2Q80Z38 1476 aa25.56■■□□□ 1.68
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ms4a2P20490 235 aa25.56■■□□□ 1.68
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zdhhc9P59268 364 aa25.56■■□□□ 1.68
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Morc2aQ69ZX6 1030 aa25.56■■□□□ 1.68
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Txnrd1Q9JMH6 613 aa25.56■■□□□ 1.68
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Smarce1O54941 411 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Il4rP16382 810 aa25.56■■□□□ 1.68
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Phf14Q9D4H9 881 aa25.56■■□□□ 1.68
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rad50P70388 1312 aa25.56■■□□□ 1.68
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kiaa0232Q80U59 1396 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atp6v1dP57746 247 aa25.55■■□□□ 1.68
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Iqsec3Q3TES0 1195 aa25.55■■□□□ 1.68
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tshz3Q8CGV9 1081 aa25.54■■□□□ 1.68
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 VgfQ0VGU4 617 aa25.54■■□□□ 1.68
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccdc7Q9D541 371 aa25.54■■□□□ 1.68
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gdpd2Q9ESM6 539 aa25.54■■□□□ 1.68
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Plekhd1B2RPU2 505 aa25.53■■□□□ 1.68
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Grm8P47743 908 aa25.53■■□□□ 1.68
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Filip1lQ6P6L0 1131 aa25.53■■□□□ 1.68
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Jakmip1Q8BVL9 626 aa25.53■■□□□ 1.68
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmx3Q8BXZ1 456 aa25.53■■□□□ 1.68
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ssfa2Q922B9 1252 aa25.53■■□□□ 1.68
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Phactr2B1AVP0 632 aa25.53■■□□□ 1.68
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Brpf1B2RRD7 1212 aa25.53■■□□□ 1.68
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 EvcP57680 1005 aa25.52■■□□□ 1.68
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 KinQ8K339 391 aa25.52■■□□□ 1.68
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bicc1Q99MQ1 977 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 ImpactO55091 318 aa25.51■■□□□ 1.67
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ppm1mQ8BU27 406 aa25.51■■□□□ 1.67
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kif20aP97329 887 aa25.5■■□□□ 1.67
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam228bQ497Q6 232 aa25.5■■□□□ 1.67
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zpr1Q62384 459 aa25.5■■□□□ 1.67
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Brf1Q8CFK2 676 aa25.5■■□□□ 1.67
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Eif3bQ8JZQ9 803 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zbtb3Q91X45 518 aa25.5■■□□□ 1.67
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 TefQ9JLC6 301 aa25.5■■□□□ 1.67
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pa2g4P50580 394 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Utp18Q5SSI6 552 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Larp1Q6ZQ58 1072 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Stk3Q9JI10 497 aa25.49■■□□□ 1.67
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm45015A0A140LII9 184 aa25.49■■□□□ 1.67
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm18336A0A140LIU8 765 aa25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 43.3 ms