RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 CSNK1A1LQ8N752 337 aa15□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 OR4K1Q8NGD4 311 aa15□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 NEIL2Q969S2 332 aa15□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 ISL2Q96A47 359 aa15□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 C10orf90Q96M02 699 aa15□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 TMEM79Q9BSE2 394 aa15□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 DHRS4Q9BTZ2 278 aa15□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 ALG9Q9H6U8 611 aa15□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 NMRAL1Q9HBL8 299 aa15□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 NDOR1Q9UHB4 597 aa15□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 ZNF180Q9UJW8 692 aa15□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 TCFL5Q9UL49 500 aa15□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 RNF112Q9ULX5 631 aa15□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 A0A096LPK6 155 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 TYK2P29597 1187 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 GGT5P36269 586 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 BCL6P41182 706 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 MAGEA12P43365 314 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 SERPINB8P50452 374 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 EMP3P54852 163 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 IL10RAQ13651 578 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 SLC29A2Q14542 456 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 FBXO48Q5FWF7 155 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 MLIPQ5VWP3 458 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 COX15Q7KZN9 410 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 SYVN1Q86TM6 617 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 TMEM151BQ8IW70 566 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 PDPRQ8NCN5 879 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 STAG3L4Q8TBR4 150 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 SLC5A11Q8WWX8 675 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 TSNARE1Q96NA8 513 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 CATSPER2Q96P56 530 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 ATOH8Q96SQ7 321 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 SPNS1Q9H2V7 528 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 TLK1Q9UKI8 766 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 IKBKGQ9Y6K9 419 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 FER1L5A0AVI2 2057 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 ANKRD12Q6UB98 2062 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 FAM208BQ5VWN6 2430 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 CDC14CA4D256 554 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 C9J4A7 227 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 KERAO60938 352 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 WDR47O94967 919 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 KLHL2O95198 593 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 STATHP02808 62 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 OR1D4P47884 311 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 CCR8P51685 355 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 FOXL2P58012 376 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 UGT8Q16880 541 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 MUM1Q2TAK8 710 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 DEFB109BQ30KR1 87 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 SULT1C3Q6IMI6 304 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 TCAIMQ8N3R3 496 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 ZNF740Q8NDX6 193 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 EXT2Q93063 718 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 ESAMQ96AP7 390 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 TM4SF19Q96DZ7 209 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 THAP11Q96EK4 314 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 WBP1Q96G27 269 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 CABS1Q96KC9 395 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 GPR78Q96P69 363 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 C17orf62Q9BQA9 187 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 SARGQ9BW04 601 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 CD274Q9NZQ7 290 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 DYRK1BQ9Y463 629 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 MAU2Q9Y6X3 613 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 TRIM49D1C9J1S8 452 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 TXNDC9O14530 226 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 KRT38O76015 456 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 SLU7O95391 586 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 MTHFD2P13995 350 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 CNTFP26441 200 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 HSPA7P48741 367 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 FAM83EQ2M2I3 478 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 GARNL3Q5VVW2 1013 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 BORAQ6PGQ7 559 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 ADGRD1Q6QNK2 874 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 NXPE4Q6UWF7 544 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 TAOK1Q7L7X3 1001 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 OVCH1Q7RTY7 1134 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 EXD3Q8N9H8 876 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-206ENST00000443528 MFSD9Q8NBP5 474 aa14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms