RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508936.1

SMAD1-AS2-201, SMAD1 antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD1-AS2, Length 1,090 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GPAMQ9HCL2 828 aa9.99□□□□□ -0.81
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 A0A1B0GTH6 734 aa9.98□□□□□ -0.81
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa9.98□□□□□ -0.81
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 BMP4P12644 408 aa9.98□□□□□ -0.81
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CD163Q86VB7 1156 aa9.98□□□□□ -0.81
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PGBD3Q8N328 593 aa9.98□□□□□ -0.81
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 THBS1P07996 1170 aa9.97□□□□□ -0.81
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa9.97□□□□□ -0.81
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa9.96□□□□□ -0.82
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SEMA6BQ9H3T3 888 aa9.95□□□□□ -0.82
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GGA1Q9UJY5 639 aa9.95□□□□□ -0.82
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TRAK2O60296 914 aa9.94□□□□□ -0.82
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GNRH1P01148 92 aa9.94□□□□□ -0.82
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SCTRP47872 440 aa9.94□□□□□ -0.82
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 EFHC2Q5JST6 749 aa9.94□□□□□ -0.82
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZNF592Q92610 1267 aa9.94□□□□□ -0.82
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DDRGK1Q96HY6 314 aa9.94□□□□□ -0.82
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa9.94□□□□□ -0.82
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PHKA2P46019 1235 aa9.93□□□□□ -0.82
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CENPCQ03188 943 aa9.93□□□□□ -0.82
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa9.93□□□□□ -0.82
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CNKSR1Q969H4 720 aa9.93□□□□□ -0.82
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 BTBD6Q96KE9 485 aa9.93□□□□□ -0.82
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 OSBPL3Q9H4L5 887 aa9.93□□□□□ -0.82
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa9.93□□□□□ -0.82
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CHRNA4P43681 627 aa9.92□□□□□ -0.82
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GNASQ5JWF2 1037 aa9.92□□□□□ -0.82
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 C2CD2LO14523 706 aa9.91□□□□□ -0.82
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FBXO45P0C2W1 286 aa9.91□□□□□ -0.82
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 EPXP11678 715 aa9.91□□□□□ -0.82
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FGFR3P22607 806 aa9.91□□□□□ -0.82
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TRIM34Q9BYJ4 488 aa9.91□□□□□ -0.82
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RUBCNLQ9H714 662 aa9.91□□□□□ -0.82
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RAB6BQ9NRW1 208 aa9.91□□□□□ -0.82
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DGKGP49619 791 aa9.9□□□□□ -0.82
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DOC2BQ14184 412 aa9.9□□□□□ -0.82
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ABHD17AQ96GS6 310 aa9.9□□□□□ -0.82
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ARAFP10398 606 aa9.89□□□□□ -0.83
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ITGB7P26010 798 aa9.89□□□□□ -0.83
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RFC5P40937 340 aa9.89□□□□□ -0.83
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RNF135Q8IUD6 432 aa9.89□□□□□ -0.83
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 IL2RAP01589 272 aa9.88□□□□□ -0.83
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MSX1P28360 303 aa9.88□□□□□ -0.83
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CTBSQ01459 385 aa9.88□□□□□ -0.83
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 BNIP3LO60238 219 aa9.86□□□□□ -0.83
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GATA4P43694 442 aa9.86□□□□□ -0.83
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FIGNL1Q6PIW4 674 aa9.86□□□□□ -0.83
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa9.86□□□□□ -0.83
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NDFIP2Q9NV92 336 aa9.86□□□□□ -0.83
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NEURL1BA8MQ27 555 aa9.85□□□□□ -0.83
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MYCP01106 439 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TMEM259Q4ZIN3 620 aa9.85□□□□□ -0.83
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 C4orf17Q53FE4 359 aa9.85□□□□□ -0.83
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FAM117AQ9C073 453 aa9.85□□□□□ -0.83
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SCO2A0A1W2PP80 73 aa9.84□□□□□ -0.83
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ESCO1Q5FWF5 840 aa9.84□□□□□ -0.83
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CHSY3Q70JA7 882 aa9.84□□□□□ -0.83
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 XAGE2Q96GT9 111 aa9.84□□□□□ -0.83
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CRISPLD1Q9H336 500 aa9.84□□□□□ -0.83
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KDM4CQ9H3R0 1056 aa9.84□□□□□ -0.83
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HRH3Q9Y5N1 445 aa9.84□□□□□ -0.83
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NR1H3Q13133 447 aa9.83□□□□□ -0.84
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa9.81□□□□□ -0.84
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ADH6P28332 368 aa9.81□□□□□ -0.84
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RHBDD1Q8TEB9 315 aa9.81□□□□□ -0.84
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa9.81□□□□□ -0.84
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa9.78□□□□□ -0.84
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PLVAPQ9BX97 442 aa9.78□□□□□ -0.84
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NLRP8Q86W28 1048 aa9.77□□□□□ -0.85
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SPDYE3A6NKU9 549 aa9.76□□□□□ -0.85
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LCE3BQ5TA77 95 aa9.76□□□□□ -0.85
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 C1orf216Q8TAB5 229 aa9.76□□□□□ -0.85
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZFP64Q9NPA5 681 aa9.76□□□□□ -0.85
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FAM182BQ5T319 152 aa9.75□□□□□ -0.85
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TRIM11Q96F44 468 aa9.75□□□□□ -0.85
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TLR1Q15399 786 aa9.74□□□□□ -0.85
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NKAPLQ5M9Q1 402 aa9.74□□□□□ -0.85
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ARTNQ5T4W7 220 aa9.74□□□□□ -0.85
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PLA2G4AP47712 749 aa9.73□□□□□ -0.85
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PRRT3Q5FWE3 981 aa9.73□□□□□ -0.85
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NBPF11Q86T75 865 aa9.73□□□□□ -0.85
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FCHSD1Q86WN1 690 aa9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.6 ms