Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NipblQ6KCD5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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