Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacs2Q3V3Q7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1519.3 ms