Protein–RNA interactions for Protein: Q14B01

Rnf113a2, Ring finger protein 113A2, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf113a2Q14B01 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Rnf113a2Q14B01 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms