Protein–RNA interactions for Protein: P59997

Kdm2a, Lysine-specific demethylase 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2aP59997 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Kdm2aP59997 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm2aP59997 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms