Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kif3aP28741 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms