Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 RNU6ATAC14P-201ENST00000516218 91 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
HOXD1Q9GZZ0 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-627P-201ENST00000364032 102 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
HOXD1Q9GZZ0 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
HOXD1Q9GZZ0 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
HOXD1Q9GZZ0 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
HOXD1Q9GZZ0 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
HOXD1Q9GZZ0 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
HOXD1Q9GZZ0 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
HOXD1Q9GZZ0 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-892P-201ENST00000410335 99 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
HOXD1Q9GZZ0 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
Retrieved 24 of 98,524 protein–RNA pairs in 5.4 ms