Protein–RNA interactions for Protein: Q13107

USP4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4Q13107 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
USP4Q13107 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
USP4Q13107 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
USP4Q13107 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
USP4Q13107 RNU6-627P-201ENST00000364032 102 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
USP4Q13107 MIR548AH-201ENST00000637109 76 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
USP4Q13107 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
USP4Q13107 SNORD115-45-201ENST00000391078 81 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
USP4Q13107 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
USP4Q13107 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
USP4Q13107 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
USP4Q13107 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
USP4Q13107 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
USP4Q13107 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
USP4Q13107 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
USP4Q13107 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
USP4Q13107 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
USP4Q13107 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
USP4Q13107 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
USP4Q13107 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
USP4Q13107 RNU6-892P-201ENST00000410335 99 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
USP4Q13107 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
USP4Q13107 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
USP4Q13107 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
Retrieved 24 of 98,524 protein–RNA pairs in 239.5 ms