Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
LY6EQ16553 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
LY6EQ16553 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
LY6EQ16553 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
LY6EQ16553 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
LY6EQ16553 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
LY6EQ16553 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
LY6EQ16553 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
LY6EQ16553 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
LY6EQ16553 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
LY6EQ16553 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
LY6EQ16553 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
LY6EQ16553 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
LY6EQ16553 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
LY6EQ16553 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
LY6EQ16553 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
LY6EQ16553 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
LY6EQ16553 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
LY6EQ16553 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
LY6EQ16553 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
LY6EQ16553 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
LY6EQ16553 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
LY6EQ16553 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
LY6EQ16553 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
LY6EQ16553 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
LY6EQ16553 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
LY6EQ16553 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
LY6EQ16553 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
LY6EQ16553 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
LY6EQ16553 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
LY6EQ16553 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
LY6EQ16553 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
LY6EQ16553 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
LY6EQ16553 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
LY6EQ16553 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
LY6EQ16553 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
LY6EQ16553 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
LY6EQ16553 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
LY6EQ16553 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
LY6EQ16553 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
LY6EQ16553 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
LY6EQ16553 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
LY6EQ16553 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
LY6EQ16553 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
LY6EQ16553 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
LY6EQ16553 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
LY6EQ16553 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
LY6EQ16553 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
LY6EQ16553 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
LY6EQ16553 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
LY6EQ16553 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
LY6EQ16553 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
LY6EQ16553 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
LY6EQ16553 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
LY6EQ16553 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
LY6EQ16553 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
LY6EQ16553 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
LY6EQ16553 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
LY6EQ16553 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
LY6EQ16553 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
LY6EQ16553 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
LY6EQ16553 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
LY6EQ16553 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
LY6EQ16553 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
LY6EQ16553 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.38□□□□□ -2.63
LY6EQ16553 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
LY6EQ16553 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
LY6EQ16553 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
LY6EQ16553 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
LY6EQ16553 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
LY6EQ16553 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
LY6EQ16553 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
LY6EQ16553 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
LY6EQ16553 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
LY6EQ16553 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
LY6EQ16553 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
LY6EQ16553 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
LY6EQ16553 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
LY6EQ16553 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
LY6EQ16553 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
LY6EQ16553 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
LY6EQ16553 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-1.42□□□□□ -2.64
LY6EQ16553 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
LY6EQ16553 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
LY6EQ16553 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
LY6EQ16553 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
LY6EQ16553 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
LY6EQ16553 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
LY6EQ16553 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
LY6EQ16553 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
LY6EQ16553 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
LY6EQ16553 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
LY6EQ16553 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
LY6EQ16553 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
LY6EQ16553 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
LY6EQ16553 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
LY6EQ16553 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
LY6EQ16553 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
LY6EQ16553 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
LY6EQ16553 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 235.1 ms