Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CTTNQ14247 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CTTNQ14247 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CTTNQ14247 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CTTNQ14247 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CTTNQ14247 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CTTNQ14247 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CTTNQ14247 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CTTNQ14247 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CTTNQ14247 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CTTNQ14247 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CTTNQ14247 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CTTNQ14247 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CTTNQ14247 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CTTNQ14247 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CTTNQ14247 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CTTNQ14247 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CTTNQ14247 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CTTNQ14247 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CTTNQ14247 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CTTNQ14247 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CTTNQ14247 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CTTNQ14247 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CTTNQ14247 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CTTNQ14247 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CTTNQ14247 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CTTNQ14247 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CTTNQ14247 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CTTNQ14247 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CTTNQ14247 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CTTNQ14247 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CTTNQ14247 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CTTNQ14247 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CTTNQ14247 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CTTNQ14247 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CTTNQ14247 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
CTTNQ14247 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
CTTNQ14247 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
CTTNQ14247 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
CTTNQ14247 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
CTTNQ14247 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
CTTNQ14247 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
CTTNQ14247 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
CTTNQ14247 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CTTNQ14247 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
CTTNQ14247 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
CTTNQ14247 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
CTTNQ14247 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CTTNQ14247 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CTTNQ14247 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CTTNQ14247 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
CTTNQ14247 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
CTTNQ14247 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
CTTNQ14247 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
CTTNQ14247 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
CTTNQ14247 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
CTTNQ14247 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
CTTNQ14247 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CTTNQ14247 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CTTNQ14247 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CTTNQ14247 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CTTNQ14247 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CTTNQ14247 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CTTNQ14247 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
CTTNQ14247 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
CTTNQ14247 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CTTNQ14247 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-1.92□□□□□ -2.72
CTTNQ14247 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CTTNQ14247 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CTTNQ14247 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CTTNQ14247 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CTTNQ14247 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CTTNQ14247 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CTTNQ14247 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CTTNQ14247 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CTTNQ14247 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CTTNQ14247 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CTTNQ14247 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CTTNQ14247 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CTTNQ14247 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CTTNQ14247 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CTTNQ14247 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CTTNQ14247 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
CTTNQ14247 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
CTTNQ14247 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CTTNQ14247 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
CTTNQ14247 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
CTTNQ14247 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
CTTNQ14247 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
CTTNQ14247 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
CTTNQ14247 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
CTTNQ14247 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
CTTNQ14247 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2□□□□□ -2.73
CTTNQ14247 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
CTTNQ14247 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
CTTNQ14247 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
CTTNQ14247 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
CTTNQ14247 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
CTTNQ14247 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CTTNQ14247 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 474.3 ms