Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SF3B2Q13435 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SF3B2Q13435 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SF3B2Q13435 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SF3B2Q13435 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SF3B2Q13435 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SF3B2Q13435 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SF3B2Q13435 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SF3B2Q13435 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SF3B2Q13435 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SF3B2Q13435 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SF3B2Q13435 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SF3B2Q13435 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SF3B2Q13435 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SF3B2Q13435 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SF3B2Q13435 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SF3B2Q13435 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SF3B2Q13435 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SF3B2Q13435 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SF3B2Q13435 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SF3B2Q13435 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SF3B2Q13435 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SF3B2Q13435 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SF3B2Q13435 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SF3B2Q13435 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SF3B2Q13435 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SF3B2Q13435 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SF3B2Q13435 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SF3B2Q13435 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SF3B2Q13435 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SF3B2Q13435 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SF3B2Q13435 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
SF3B2Q13435 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SF3B2Q13435 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SF3B2Q13435 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SF3B2Q13435 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
SF3B2Q13435 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SF3B2Q13435 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SF3B2Q13435 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SF3B2Q13435 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SF3B2Q13435 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SF3B2Q13435 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SF3B2Q13435 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SF3B2Q13435 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SF3B2Q13435 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SF3B2Q13435 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SF3B2Q13435 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SF3B2Q13435 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SF3B2Q13435 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
SF3B2Q13435 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SF3B2Q13435 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SF3B2Q13435 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SF3B2Q13435 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SF3B2Q13435 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SF3B2Q13435 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SF3B2Q13435 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SF3B2Q13435 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SF3B2Q13435 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SF3B2Q13435 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SF3B2Q13435 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SF3B2Q13435 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SF3B2Q13435 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SF3B2Q13435 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SF3B2Q13435 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SF3B2Q13435 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SF3B2Q13435 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SF3B2Q13435 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SF3B2Q13435 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SF3B2Q13435 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SF3B2Q13435 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SF3B2Q13435 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SF3B2Q13435 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SF3B2Q13435 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SF3B2Q13435 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SF3B2Q13435 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SF3B2Q13435 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SF3B2Q13435 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SF3B2Q13435 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SF3B2Q13435 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SF3B2Q13435 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SF3B2Q13435 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SF3B2Q13435 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SF3B2Q13435 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SF3B2Q13435 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SF3B2Q13435 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SF3B2Q13435 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SF3B2Q13435 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SF3B2Q13435 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SF3B2Q13435 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SF3B2Q13435 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SF3B2Q13435 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SF3B2Q13435 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SF3B2Q13435 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SF3B2Q13435 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SF3B2Q13435 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SF3B2Q13435 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SF3B2Q13435 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SF3B2Q13435 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
SF3B2Q13435 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SF3B2Q13435 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
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