Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SP140Q13342 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
SP140Q13342 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SP140Q13342 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SP140Q13342 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SP140Q13342 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SP140Q13342 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SP140Q13342 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SP140Q13342 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SP140Q13342 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SP140Q13342 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SP140Q13342 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SP140Q13342 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SP140Q13342 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SP140Q13342 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SP140Q13342 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SP140Q13342 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SP140Q13342 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SP140Q13342 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SP140Q13342 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SP140Q13342 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SP140Q13342 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SP140Q13342 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SP140Q13342 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SP140Q13342 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SP140Q13342 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SP140Q13342 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SP140Q13342 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SP140Q13342 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SP140Q13342 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
SP140Q13342 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SP140Q13342 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SP140Q13342 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SP140Q13342 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SP140Q13342 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SP140Q13342 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SP140Q13342 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SP140Q13342 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SP140Q13342 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SP140Q13342 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SP140Q13342 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SP140Q13342 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SP140Q13342 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SP140Q13342 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SP140Q13342 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SP140Q13342 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SP140Q13342 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SP140Q13342 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SP140Q13342 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SP140Q13342 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SP140Q13342 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SP140Q13342 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SP140Q13342 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SP140Q13342 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SP140Q13342 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SP140Q13342 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SP140Q13342 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SP140Q13342 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SP140Q13342 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SP140Q13342 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SP140Q13342 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SP140Q13342 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SP140Q13342 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SP140Q13342 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SP140Q13342 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SP140Q13342 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SP140Q13342 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SP140Q13342 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SP140Q13342 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SP140Q13342 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
SP140Q13342 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SP140Q13342 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SP140Q13342 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SP140Q13342 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SP140Q13342 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SP140Q13342 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SP140Q13342 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SP140Q13342 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SP140Q13342 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SP140Q13342 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SP140Q13342 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SP140Q13342 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SP140Q13342 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SP140Q13342 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SP140Q13342 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SP140Q13342 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SP140Q13342 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SP140Q13342 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SP140Q13342 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SP140Q13342 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SP140Q13342 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SP140Q13342 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SP140Q13342 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SP140Q13342 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SP140Q13342 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SP140Q13342 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SP140Q13342 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SP140Q13342 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SP140Q13342 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SP140Q13342 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 268.3 ms