Protein–RNA interactions for Protein: P28356

HOXD9, Homeobox protein Hox-D9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9P28356 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HOXD9P28356 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HOXD9P28356 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HOXD9P28356 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HOXD9P28356 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HOXD9P28356 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HOXD9P28356 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HOXD9P28356 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HOXD9P28356 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HOXD9P28356 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HOXD9P28356 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HOXD9P28356 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HOXD9P28356 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HOXD9P28356 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HOXD9P28356 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HOXD9P28356 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HOXD9P28356 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HOXD9P28356 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HOXD9P28356 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HOXD9P28356 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HOXD9P28356 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HOXD9P28356 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HOXD9P28356 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HOXD9P28356 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HOXD9P28356 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
HOXD9P28356 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HOXD9P28356 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HOXD9P28356 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HOXD9P28356 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
HOXD9P28356 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HOXD9P28356 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HOXD9P28356 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HOXD9P28356 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HOXD9P28356 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
HOXD9P28356 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HOXD9P28356 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HOXD9P28356 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HOXD9P28356 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HOXD9P28356 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
HOXD9P28356 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
HOXD9P28356 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HOXD9P28356 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HOXD9P28356 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HOXD9P28356 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HOXD9P28356 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HOXD9P28356 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HOXD9P28356 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HOXD9P28356 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HOXD9P28356 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HOXD9P28356 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HOXD9P28356 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HOXD9P28356 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HOXD9P28356 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HOXD9P28356 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HOXD9P28356 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HOXD9P28356 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HOXD9P28356 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HOXD9P28356 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HOXD9P28356 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HOXD9P28356 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HOXD9P28356 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HOXD9P28356 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HOXD9P28356 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
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HOXD9P28356 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HOXD9P28356 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HOXD9P28356 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HOXD9P28356 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HOXD9P28356 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HOXD9P28356 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HOXD9P28356 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HOXD9P28356 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HOXD9P28356 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HOXD9P28356 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HOXD9P28356 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HOXD9P28356 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
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HOXD9P28356 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HOXD9P28356 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
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HOXD9P28356 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HOXD9P28356 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HOXD9P28356 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HOXD9P28356 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HOXD9P28356 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HOXD9P28356 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HOXD9P28356 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HOXD9P28356 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HOXD9P28356 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HOXD9P28356 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HOXD9P28356 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HOXD9P28356 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HOXD9P28356 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HOXD9P28356 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HOXD9P28356 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
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