Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HERPUD2Q9BSE4 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HERPUD2Q9BSE4 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HERPUD2Q9BSE4 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HERPUD2Q9BSE4 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERPUD2Q9BSE4 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERPUD2Q9BSE4 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERPUD2Q9BSE4 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERPUD2Q9BSE4 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERPUD2Q9BSE4 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERPUD2Q9BSE4 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERPUD2Q9BSE4 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERPUD2Q9BSE4 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERPUD2Q9BSE4 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HERPUD2Q9BSE4 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HERPUD2Q9BSE4 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HERPUD2Q9BSE4 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HERPUD2Q9BSE4 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HERPUD2Q9BSE4 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HERPUD2Q9BSE4 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HERPUD2Q9BSE4 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HERPUD2Q9BSE4 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HERPUD2Q9BSE4 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HERPUD2Q9BSE4 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERPUD2Q9BSE4 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERPUD2Q9BSE4 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERPUD2Q9BSE4 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERPUD2Q9BSE4 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERPUD2Q9BSE4 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERPUD2Q9BSE4 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HERPUD2Q9BSE4 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HERPUD2Q9BSE4 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HERPUD2Q9BSE4 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HERPUD2Q9BSE4 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HERPUD2Q9BSE4 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
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HERPUD2Q9BSE4 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HERPUD2Q9BSE4 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
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HERPUD2Q9BSE4 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HERPUD2Q9BSE4 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HERPUD2Q9BSE4 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.08□□□□□ -2.4
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HERPUD2Q9BSE4 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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HERPUD2Q9BSE4 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HERPUD2Q9BSE4 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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HERPUD2Q9BSE4 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HERPUD2Q9BSE4 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HERPUD2Q9BSE4 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HERPUD2Q9BSE4 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
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HERPUD2Q9BSE4 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HERPUD2Q9BSE4 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HERPUD2Q9BSE4 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HERPUD2Q9BSE4 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HERPUD2Q9BSE4 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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HERPUD2Q9BSE4 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
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HERPUD2Q9BSE4 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HERPUD2Q9BSE4 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HERPUD2Q9BSE4 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HERPUD2Q9BSE4 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HERPUD2Q9BSE4 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
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HERPUD2Q9BSE4 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HERPUD2Q9BSE4 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC0□□□□□ -2.41
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