Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SRSF6Q13247 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SRSF6Q13247 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SRSF6Q13247 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SRSF6Q13247 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SRSF6Q13247 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SRSF6Q13247 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SRSF6Q13247 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SRSF6Q13247 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SRSF6Q13247 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SRSF6Q13247 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SRSF6Q13247 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SRSF6Q13247 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SRSF6Q13247 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SRSF6Q13247 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SRSF6Q13247 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SRSF6Q13247 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SRSF6Q13247 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SRSF6Q13247 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SRSF6Q13247 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SRSF6Q13247 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SRSF6Q13247 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SRSF6Q13247 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SRSF6Q13247 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SRSF6Q13247 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SRSF6Q13247 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SRSF6Q13247 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SRSF6Q13247 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SRSF6Q13247 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SRSF6Q13247 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SRSF6Q13247 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SRSF6Q13247 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SRSF6Q13247 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SRSF6Q13247 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SRSF6Q13247 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SRSF6Q13247 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SRSF6Q13247 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SRSF6Q13247 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SRSF6Q13247 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SRSF6Q13247 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SRSF6Q13247 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SRSF6Q13247 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SRSF6Q13247 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SRSF6Q13247 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SRSF6Q13247 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SRSF6Q13247 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SRSF6Q13247 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SRSF6Q13247 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SRSF6Q13247 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SRSF6Q13247 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SRSF6Q13247 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SRSF6Q13247 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SRSF6Q13247 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SRSF6Q13247 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SRSF6Q13247 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SRSF6Q13247 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SRSF6Q13247 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SRSF6Q13247 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SRSF6Q13247 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-1.4□□□□□ -2.63
SRSF6Q13247 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SRSF6Q13247 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SRSF6Q13247 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SRSF6Q13247 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-1.4□□□□□ -2.63
SRSF6Q13247 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SRSF6Q13247 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SRSF6Q13247 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-1.43□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 234.9 ms