Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CBX3Q13185 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CBX3Q13185 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CBX3Q13185 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CBX3Q13185 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
CBX3Q13185 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
CBX3Q13185 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
CBX3Q13185 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CBX3Q13185 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CBX3Q13185 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CBX3Q13185 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CBX3Q13185 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CBX3Q13185 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
CBX3Q13185 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
CBX3Q13185 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
CBX3Q13185 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
CBX3Q13185 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
CBX3Q13185 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
CBX3Q13185 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
CBX3Q13185 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
CBX3Q13185 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
CBX3Q13185 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CBX3Q13185 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
CBX3Q13185 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
CBX3Q13185 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
CBX3Q13185 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
CBX3Q13185 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
CBX3Q13185 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
CBX3Q13185 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
CBX3Q13185 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
CBX3Q13185 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
CBX3Q13185 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
CBX3Q13185 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
CBX3Q13185 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
CBX3Q13185 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
CBX3Q13185 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
CBX3Q13185 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
CBX3Q13185 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
CBX3Q13185 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
CBX3Q13185 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
CBX3Q13185 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
CBX3Q13185 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
CBX3Q13185 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
CBX3Q13185 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
CBX3Q13185 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
CBX3Q13185 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
CBX3Q13185 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
CBX3Q13185 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
CBX3Q13185 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
CBX3Q13185 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
CBX3Q13185 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
CBX3Q13185 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CBX3Q13185 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CBX3Q13185 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CBX3Q13185 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CBX3Q13185 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CBX3Q13185 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CBX3Q13185 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CBX3Q13185 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CBX3Q13185 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CBX3Q13185 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CBX3Q13185 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CBX3Q13185 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CBX3Q13185 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CBX3Q13185 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CBX3Q13185 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CBX3Q13185 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CBX3Q13185 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CBX3Q13185 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CBX3Q13185 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CBX3Q13185 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CBX3Q13185 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CBX3Q13185 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CBX3Q13185 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CBX3Q13185 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CBX3Q13185 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CBX3Q13185 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CBX3Q13185 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CBX3Q13185 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CBX3Q13185 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CBX3Q13185 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CBX3Q13185 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
CBX3Q13185 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
CBX3Q13185 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
CBX3Q13185 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CBX3Q13185 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CBX3Q13185 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CBX3Q13185 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CBX3Q13185 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CBX3Q13185 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CBX3Q13185 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CBX3Q13185 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CBX3Q13185 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CBX3Q13185 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CBX3Q13185 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CBX3Q13185 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CBX3Q13185 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CBX3Q13185 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CBX3Q13185 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CBX3Q13185 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-2.56□□□□□ -2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms