Protein–RNA interactions for Protein: O43556

SGCE, Epsilon-sarcoglycan, humanhuman

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCEO43556 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
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SGCEO43556 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SGCEO43556 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SGCEO43556 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SGCEO43556 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SGCEO43556 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SGCEO43556 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SGCEO43556 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SGCEO43556 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SGCEO43556 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
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SGCEO43556 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SGCEO43556 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SGCEO43556 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SGCEO43556 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SGCEO43556 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SGCEO43556 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SGCEO43556 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SGCEO43556 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SGCEO43556 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SGCEO43556 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SGCEO43556 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
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SGCEO43556 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SGCEO43556 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SGCEO43556 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SGCEO43556 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
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SGCEO43556 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SGCEO43556 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SGCEO43556 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SGCEO43556 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SGCEO43556 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SGCEO43556 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SGCEO43556 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SGCEO43556 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SGCEO43556 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
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SGCEO43556 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SGCEO43556 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SGCEO43556 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SGCEO43556 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SGCEO43556 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SGCEO43556 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
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SGCEO43556 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
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SGCEO43556 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SGCEO43556 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-2.4□□□□□ -2.79
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SGCEO43556 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SGCEO43556 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
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SGCEO43556 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SGCEO43556 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SGCEO43556 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SGCEO43556 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SGCEO43556 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
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