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Protein–RNA interactions for Protein: O15061
SYNM, Synemin, human
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RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
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Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
SYNM
O15061
SNORD77.2-201
ENST00000391045
68 nt
BASIC
-3.88
□□□□□ -3.03
SYNM
O15061
U7.2-201
ENST00000607576
63 nt
BASIC
-3.88
□□□□□ -3.03
SYNM
O15061
SNORA27.2-201
ENST00000363365
126 nt
BASIC
-3.89
□□□□□ -3.03
SYNM
O15061
MIR509-1-201
ENST00000385265
94 nt
BASIC
-3.89
□□□□□ -3.03
SYNM
O15061
MIR509-2-201
ENST00000390724
91 nt
BASIC
-3.89
□□□□□ -3.03
SYNM
O15061
Y_RNA.609-201
ENST00000410669
89 nt
BASIC
-3.89
□□□□□ -3.03
SYNM
O15061
SNORD18C-201
ENST00000362704
69 nt
BASIC
-3.9
□□□□□ -3.03
SYNM
O15061
RNU6-537P-201
ENST00000517277
103 nt
BASIC
-3.9
□□□□□ -3.03
SYNM
O15061
RNU7-153P-201
ENST00000516455
62 nt
BASIC
-3.91
□□□□□ -3.04
SYNM
O15061
AC005520.4-201
ENST00000604337
90 nt
BASIC
-3.91
□□□□□ -3.04
SYNM
O15061
Y_RNA.200-201
ENST00000364018
102 nt
BASIC
-3.92
□□□□□ -3.04
SYNM
O15061
Y_RNA.272-201
ENST00000364696
102 nt
BASIC
-3.92
□□□□□ -3.04
SYNM
O15061
MIR3675-201
ENST00000583661
73 nt
BASIC
-3.92
□□□□□ -3.04
SYNM
O15061
MTND4P29-201
ENST00000503122
1372 nt
BASIC
-3.93
□□□□□ -3.04
SYNM
O15061
SNORD116-10-201
ENST00000363791
102 nt
BASIC
-3.93
□□□□□ -3.04
SYNM
O15061
Y_RNA.202-201
ENST00000364083
110 nt
BASIC
-3.93
□□□□□ -3.04
SYNM
O15061
Y_RNA.420-201
ENST00000384043
110 nt
BASIC
-3.93
□□□□□ -3.04
SYNM
O15061
SNORA81.3-201
ENST00000517283
198 nt
BASIC
-3.93
□□□□□ -3.04
SYNM
O15061
MIR3171-201
ENST00000584270
74 nt
BASIC
-3.93
□□□□□ -3.04
SYNM
O15061
AC072026.1-201
ENST00000605023
201 nt
BASIC
-3.93
□□□□□ -3.04
SYNM
O15061
U4.4-201
ENST00000620626
117 nt
BASIC
-3.93
□□□□□ -3.04
SYNM
O15061
Y_RNA.349-201
ENST00000365406
102 nt
BASIC
-3.94
□□□□□ -3.04
SYNM
O15061
Y_RNA.509-201
ENST00000384506
99 nt
BASIC
-3.94
□□□□□ -3.04
SYNM
O15061
MT-TD-201
ENST00000387419
68 nt
BASIC
-3.94
□□□□□ -3.04
SYNM
O15061
AC141273.2-201
ENST00000618989
130 nt
BASIC
-3.94
□□□□□ -3.04
SYNM
O15061
Y_RNA.459-201
ENST00000384251
102 nt
BASIC
-3.95
□□□□□ -3.04
SYNM
O15061
MIR5693-201
ENST00000577722
73 nt
BASIC
-3.95
□□□□□ -3.04
SYNM
O15061
MIR548V-201
ENST00000584165
80 nt
BASIC
-3.95
□□□□□ -3.04
SYNM
O15061
Y_RNA.216-201
ENST00000364205
93 nt
BASIC
-3.96
□□□□□ -3.04
SYNM
O15061
Y_RNA.478-201
ENST00000384358
107 nt
BASIC
-3.96
□□□□□ -3.04
SYNM
O15061
RNU6-995P-201
ENST00000391244
107 nt
BASIC
-3.97
□□□□□ -3.04
SYNM
O15061
SCARNA23-201
ENST00000516060
130 nt
BASIC
-3.97
□□□□□ -3.04
SYNM
O15061
Y_RNA.574-201
ENST00000384766
95 nt
BASIC
-3.97
□□□□□ -3.05
SYNM
O15061
RNU4-40P-201
ENST00000364351
143 nt
BASIC
-3.98
□□□□□ -3.05
SYNM
O15061
MIRLET7A2-201
ENST00000362105
72 nt
BASIC
-3.99
□□□□□ -3.05
SYNM
O15061
RNU6-1081P-201
ENST00000384537
107 nt
BASIC
-3.99
□□□□□ -3.05
SYNM
O15061
Y_RNA.520-201
ENST00000384556
102 nt
BASIC
-3.99
□□□□□ -3.05
SYNM
O15061
Y_RNA.657-201
ENST00000515983
102 nt
BASIC
-3.99
□□□□□ -3.05
SYNM
O15061
Y_RNA.240-201
ENST00000364469
95 nt
BASIC
-4
□□□□□ -3.05
SYNM
O15061
SNORD113-2-201
ENST00000391082
72 nt
BASIC
-4
□□□□□ -3.05
SYNM
O15061
MTND5P20-201
ENST00000448677
143 nt
BASIC
-4.01
□□□□□ -3.05
SYNM
O15061
MIR630-201
ENST00000384957
97 nt
BASIC
-4.02
□□□□□ -3.05
SYNM
O15061
Y_RNA.11-201
ENST00000362375
109 nt
BASIC
-4.02
□□□□□ -3.05
SYNM
O15061
MIR548X2-201
ENST00000579776
100 nt
BASIC
-4.02
□□□□□ -3.05
SYNM
O15061
SNORD116-16-201
ENST00000384533
92 nt
BASIC
-4.03
□□□□□ -3.05
SYNM
O15061
RNY4P25-201
ENST00000459254
96 nt
BASIC
-4.03
□□□□□ -3.05
SYNM
O15061
RNA5SP215-201
ENST00000363440
122 nt
BASIC
-4.04
□□□□□ -3.06
SYNM
O15061
RNY4P18-201
ENST00000391107
89 nt
BASIC
-4.05
□□□□□ -3.06
SYNM
O15061
MTATP8P1-201
ENST00000467115
207 nt
BASIC
-4.05
□□□□□ -3.06
SYNM
O15061
Y_RNA.662-201
ENST00000516028
97 nt
BASIC
-4.05
□□□□□ -3.06
SYNM
O15061
AL157777.2-201
ENST00000258070
137 nt
BASIC
-4.06
□□□□□ -3.06
SYNM
O15061
Y_RNA.134-201
ENST00000363435
105 nt
BASIC
-4.06
□□□□□ -3.06
SYNM
O15061
RNU7-151P-201
ENST00000516930
53 nt
BASIC
-4.06
□□□□□ -3.06
SYNM
O15061
Y_RNA.649-201
ENST00000459077
103 nt
BASIC
-4.06
□□□□□ -3.06
SYNM
O15061
RNU6-1108P-201
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104 nt
BASIC
-4.06
□□□□□ -3.06
SYNM
O15061
Y_RNA.138-201
ENST00000363462
102 nt
BASIC
-4.07
□□□□□ -3.06
SYNM
O15061
RNU6-669P-201
ENST00000365575
107 nt
BASIC
-4.07
□□□□□ -3.06
SYNM
O15061
MIR519C-201
ENST00000385053
87 nt
BASIC
-4.07
□□□□□ -3.06
SYNM
O15061
Y_RNA.629-201
ENST00000411368
105 nt
BASIC
-4.07
□□□□□ -3.06
SYNM
O15061
RNU6-982P-201
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102 nt
BASIC
-4.07
□□□□□ -3.06
SYNM
O15061
AC020661.2-201
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134 nt
BASIC
-4.07
□□□□□ -3.06
SYNM
O15061
SNORD63.2-201
ENST00000516303
64 nt
BASIC
-4.08
□□□□□ -3.06
SYNM
O15061
SPRY4-IT1_2.1-201
ENST00000612613
121 nt
BASIC
-4.08
□□□□□ -3.06
SYNM
O15061
RNY1P1-201
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112 nt
BASIC
-4.09
□□□□□ -3.06
SYNM
O15061
Y_RNA.350-201
ENST00000365409
98 nt
BASIC
-4.09
□□□□□ -3.06
SYNM
O15061
RNU6-111P-201
ENST00000517179
105 nt
BASIC
-4.09
□□□□□ -3.06
SYNM
O15061
SNORD45.1-201
ENST00000363181
77 nt
BASIC
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□□□□□ -3.07
SYNM
O15061
SNORD113-3-201
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72 nt
BASIC
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□□□□□ -3.07
SYNM
O15061
Y_RNA.580-201
ENST00000391004
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BASIC
-4.1
□□□□□ -3.07
SYNM
O15061
MIR3128-201
ENST00000581957
66 nt
BASIC
-4.1
□□□□□ -3.07
SYNM
O15061
SNORD60-201
ENST00000383903
83 nt
BASIC
-4.11
□□□□□ -3.07
SYNM
O15061
RNU6-1324P-201
ENST00000384222
107 nt
BASIC
-4.11
□□□□□ -3.07
SYNM
O15061
TRAJ61-201
ENST00000390479
60 nt
APPRIS P1
BASIC
-4.11
□□□□□ -3.07
SYNM
O15061
RNU6-129P-201
ENST00000391022
107 nt
BASIC
-4.11
□□□□□ -3.07
SYNM
O15061
MTND4LP1-201
ENST00000446263
157 nt
BASIC
-4.11
□□□□□ -3.07
SYNM
O15061
SNORA20.1-201
ENST00000364790
130 nt
BASIC
-4.12
□□□□□ -3.07
SYNM
O15061
MIR581-201
ENST00000384895
96 nt
BASIC
-4.12
□□□□□ -3.07
SYNM
O15061
SNORD115-37-201
ENST00000363768
82 nt
BASIC
-4.13
□□□□□ -3.07
SYNM
O15061
Y_RNA.460-201
ENST00000384255
102 nt
BASIC
-4.13
□□□□□ -3.07
SYNM
O15061
Y_RNA.702-201
ENST00000516843
96 nt
BASIC
-4.13
□□□□□ -3.07
SYNM
O15061
Y_RNA.79-201
ENST00000362992
113 nt
BASIC
-4.14
□□□□□ -3.07
SYNM
O15061
RNU6-772P-201
ENST00000516042
105 nt
BASIC
-4.14
□□□□□ -3.07
SYNM
O15061
RNY3P8-201
ENST00000411366
126 nt
BASIC
-4.14
□□□□□ -3.07
SYNM
O15061
RNU6-182P-201
ENST00000516970
105 nt
BASIC
-4.15
□□□□□ -3.07
SYNM
O15061
RNU6-624P-201
ENST00000363411
107 nt
BASIC
-4.16
□□□□□ -3.08
SYNM
O15061
Y_RNA.321-201
ENST00000365149
102 nt
BASIC
-4.16
□□□□□ -3.08
SYNM
O15061
ZEB2_AS1_4.1-201
ENST00000615159
78 nt
BASIC
-4.16
□□□□□ -3.08
SYNM
O15061
Y_RNA.47-201
ENST00000362697
108 nt
BASIC
-4.17
□□□□□ -3.08
SYNM
O15061
Y_RNA.266-201
ENST00000364678
96 nt
BASIC
-4.17
□□□□□ -3.08
SYNM
O15061
RNU6-574P-201
ENST00000384265
107 nt
BASIC
-4.17
□□□□□ -3.08
SYNM
O15061
SNORD1B-201
ENST00000363091
84 nt
BASIC
-4.18
□□□□□ -3.08
SYNM
O15061
Y_RNA.586-201
ENST00000391146
98 nt
BASIC
-4.18
□□□□□ -3.08
SYNM
O15061
RNU7-61P-201
ENST00000515897
61 nt
BASIC
-4.18
□□□□□ -3.08
SYNM
O15061
Y_RNA.680-201
ENST00000516441
93 nt
BASIC
-4.18
□□□□□ -3.08
SYNM
O15061
MTRNR2L9-201
ENST00000622562
75 nt
BASIC
-4.18
□□□□□ -3.08
SYNM
O15061
RNU6-330P-201
ENST00000363015
107 nt
BASIC
-4.19
□□□□□ -3.08
SYNM
O15061
RNA5SP173-201
ENST00000364857
136 nt
BASIC
-4.19
□□□□□ -3.08
SYNM
O15061
RNU6-1044P-201
ENST00000384755
107 nt
BASIC
-4.19
□□□□□ -3.08
SYNM
O15061
RNU6-604P-201
ENST00000390917
100 nt
BASIC
-4.19
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SYNM
O15061
RNU6-1023P-201
ENST00000516137
106 nt
BASIC
-4.19
□□□□□ -3.08
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