Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PHACTR1Q9C0D0 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PHACTR1Q9C0D0 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PHACTR1Q9C0D0 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PHACTR1Q9C0D0 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PHACTR1Q9C0D0 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PHACTR1Q9C0D0 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.75□□□□□ -2.29
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PHACTR1Q9C0D0 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PHACTR1Q9C0D0 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PHACTR1Q9C0D0 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PHACTR1Q9C0D0 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PHACTR1Q9C0D0 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PHACTR1Q9C0D0 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PHACTR1Q9C0D0 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PHACTR1Q9C0D0 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PHACTR1Q9C0D0 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PHACTR1Q9C0D0 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PHACTR1Q9C0D0 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PHACTR1Q9C0D0 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PHACTR1Q9C0D0 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PHACTR1Q9C0D0 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PHACTR1Q9C0D0 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PHACTR1Q9C0D0 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PHACTR1Q9C0D0 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PHACTR1Q9C0D0 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PHACTR1Q9C0D0 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PHACTR1Q9C0D0 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PHACTR1Q9C0D0 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PHACTR1Q9C0D0 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PHACTR1Q9C0D0 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PHACTR1Q9C0D0 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PHACTR1Q9C0D0 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PHACTR1Q9C0D0 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PHACTR1Q9C0D0 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PHACTR1Q9C0D0 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PHACTR1Q9C0D0 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
PHACTR1Q9C0D0 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PHACTR1Q9C0D0 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PHACTR1Q9C0D0 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PHACTR1Q9C0D0 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PHACTR1Q9C0D0 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PHACTR1Q9C0D0 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PHACTR1Q9C0D0 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PHACTR1Q9C0D0 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PHACTR1Q9C0D0 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PHACTR1Q9C0D0 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PHACTR1Q9C0D0 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PHACTR1Q9C0D0 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PHACTR1Q9C0D0 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PHACTR1Q9C0D0 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PHACTR1Q9C0D0 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PHACTR1Q9C0D0 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PHACTR1Q9C0D0 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PHACTR1Q9C0D0 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PHACTR1Q9C0D0 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PHACTR1Q9C0D0 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PHACTR1Q9C0D0 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PHACTR1Q9C0D0 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PHACTR1Q9C0D0 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PHACTR1Q9C0D0 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PHACTR1Q9C0D0 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PHACTR1Q9C0D0 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PHACTR1Q9C0D0 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PHACTR1Q9C0D0 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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