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Protein–RNA interactions for Protein: Q13214
SEMA3B, Semaphorin-3B, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
SEMA3B
Q13214
MIR214-201
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110 nt
BASIC
-0.14
□□□□□ -2.43
SEMA3B
Q13214
SNORA26.2-201
ENST00000390922
122 nt
BASIC
-0.14
□□□□□ -2.43
SEMA3B
Q13214
AC074348.1-201
ENST00000426503
132 nt
BASIC
-0.14
□□□□□ -2.43
SEMA3B
Q13214
Y_RNA.633-201
ENST00000459107
95 nt
BASIC
-0.14
□□□□□ -2.43
SEMA3B
Q13214
RNA5SP147-201
ENST00000516493
109 nt
BASIC
-0.14
□□□□□ -2.43
SEMA3B
Q13214
MIR4645-201
ENST00000583158
77 nt
BASIC
-0.14
□□□□□ -2.43
SEMA3B
Q13214
RNA5SP368-201
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116 nt
BASIC
-0.15
□□□□□ -2.43
SEMA3B
Q13214
SNORA15B-2-201
ENST00000384058
135 nt
BASIC
-0.15
□□□□□ -2.43
SEMA3B
Q13214
SNORA15B-1-201
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135 nt
BASIC
-0.15
□□□□□ -2.43
SEMA3B
Q13214
RNY4P29-201
ENST00000410801
97 nt
BASIC
-0.15
□□□□□ -2.43
SEMA3B
Q13214
AC244250.2-201
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148 nt
BASIC
-0.15
□□□□□ -2.43
SEMA3B
Q13214
SYCP2-202
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5479 nt
APPRIS P2
TSL 1 (best)
BASIC
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□□□□□ -2.43
SEMA3B
Q13214
RNU6-1094P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SEMA3B
Q13214
SNORD49B-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SEMA3B
Q13214
RNU6-30P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SEMA3B
Q13214
MIR3675-201
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BASIC
-0.16
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SEMA3B
Q13214
MIR655-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SEMA3B
Q13214
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SEMA3B
Q13214
SNORD114-12-201
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75 nt
BASIC
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□□□□□ -2.44
SEMA3B
Q13214
MIR1302-4-201
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150 nt
BASIC
-0.17
□□□□□ -2.44
SEMA3B
Q13214
AC108676.2-201
ENST00000605225
163 nt
BASIC
-0.17
□□□□□ -2.44
SEMA3B
Q13214
RNU6-502P-201
ENST00000362419
108 nt
BASIC
-0.18
□□□□□ -2.44
SEMA3B
Q13214
Y_RNA.313-201
ENST00000365095
103 nt
BASIC
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□□□□□ -2.44
SEMA3B
Q13214
RNU6-455P-201
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107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.44
SEMA3B
Q13214
MIR4712-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SEMA3B
Q13214
U6.96-201
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BASIC
-0.18
□□□□□ -2.44
SEMA3B
Q13214
RNU6-900P-201
ENST00000384498
102 nt
BASIC
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□□□□□ -2.44
SEMA3B
Q13214
Y_RNA.532-201
ENST00000384590
113 nt
BASIC
-0.19
□□□□□ -2.44
SEMA3B
Q13214
MIR6773-201
ENST00000612812
74 nt
BASIC
-0.19
□□□□□ -2.44
SEMA3B
Q13214
MIR101-1-201
ENST00000362265
75 nt
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
SEMA3B
Q13214
RNU6-330P-201
ENST00000363015
107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.44
SEMA3B
Q13214
SNORA8.1-201
ENST00000384250
140 nt
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
SEMA3B
Q13214
RNU6-1162P-201
ENST00000384443
104 nt
BASIC
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□□□□□ -2.44
SEMA3B
Q13214
SNORD4A-201
ENST00000459174
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BASIC
-0.2
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SEMA3B
Q13214
MIR4484-201
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BASIC
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SEMA3B
Q13214
MIR6739-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SEMA3B
Q13214
MIR4679-1-201
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75 nt
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
SEMA3B
Q13214
SNORD95.1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SEMA3B
Q13214
Y_RNA.388-201
ENST00000383919
113 nt
BASIC
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□□□□□ -2.44
SEMA3B
Q13214
RNU6-787P-201
ENST00000384032
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□□□□□ -2.44
SEMA3B
Q13214
MIR521-2-201
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SEMA3B
Q13214
MIR9-2-201
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87 nt
BASIC
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□□□□□ -2.44
SEMA3B
Q13214
RNA5SP173-201
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BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
SEMA3B
Q13214
AL078612.1-201
ENST00000533009
150 nt
TSL 5
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
SEMA3B
Q13214
MIR4263-201
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83 nt
BASIC
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□□□□□ -2.44
SEMA3B
Q13214
MIR3202-2-201
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□□□□□ -2.44
SEMA3B
Q13214
Y_RNA.94-201
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SEMA3B
Q13214
RNU6-337P-201
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SEMA3B
Q13214
RNU7-55P-201
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SEMA3B
Q13214
MIR3666-201
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SEMA3B
Q13214
SNORD114-28-201
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BASIC
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□□□□□ -2.45
SEMA3B
Q13214
SNORA33.1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.45
SEMA3B
Q13214
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106 nt
BASIC
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□□□□□ -2.45
SEMA3B
Q13214
MIRLET7B-201
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BASIC
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□□□□□ -2.45
SEMA3B
Q13214
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TSL 3
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□□□□□ -2.45
SEMA3B
Q13214
RNA5SP331-201
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□□□□□ -2.45
SEMA3B
Q13214
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103 nt
BASIC
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□□□□□ -2.45
SEMA3B
Q13214
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□□□□□ -2.45
SEMA3B
Q13214
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BASIC
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SEMA3B
Q13214
SNORD45.1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.45
SEMA3B
Q13214
RNU6-901P-201
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□□□□□ -2.45
SEMA3B
Q13214
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BASIC
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□□□□□ -2.45
SEMA3B
Q13214
RPS29P8-201
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SEMA3B
Q13214
RNU6-973P-201
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□□□□□ -2.45
SEMA3B
Q13214
RNU6-1133P-201
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BASIC
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SEMA3B
Q13214
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□□□□□ -2.45
SEMA3B
Q13214
snoR1.1-201
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□□□□□ -2.45
SEMA3B
Q13214
RNU6-1124P-201
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SEMA3B
Q13214
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□□□□□ -2.46
SEMA3B
Q13214
SCARNA18B-201
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□□□□□ -2.46
SEMA3B
Q13214
RNA5SP67-201
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□□□□□ -2.46
SEMA3B
Q13214
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□□□□□ -2.46
SEMA3B
Q13214
AL590491.3-201
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□□□□□ -2.46
SEMA3B
Q13214
uc_338.36-201
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BASIC
-0.29
□□□□□ -2.46
SEMA3B
Q13214
RNU6-604P-201
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BASIC
-0.3
□□□□□ -2.46
SEMA3B
Q13214
RNU6-656P-201
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□□□□□ -2.46
SEMA3B
Q13214
MIR8053-201
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BASIC
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□□□□□ -2.46
SEMA3B
Q13214
RNU6-645P-201
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106 nt
BASIC
-0.31
□□□□□ -2.46
SEMA3B
Q13214
SNORD56B-201
ENST00000384713
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BASIC
-0.31
□□□□□ -2.46
SEMA3B
Q13214
AC096531.1-201
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107 nt
BASIC
-0.31
□□□□□ -2.46
SEMA3B
Q13214
RNA5SP66-201
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101 nt
BASIC
-0.31
□□□□□ -2.46
SEMA3B
Q13214
MIR4432-201
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84 nt
BASIC
-0.31
□□□□□ -2.46
SEMA3B
Q13214
MIR409-201
ENST00000362237
79 nt
BASIC
-0.32
□□□□□ -2.46
SEMA3B
Q13214
RNU6-228P-201
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106 nt
BASIC
-0.32
□□□□□ -2.46
SEMA3B
Q13214
SNORD115-23-201
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BASIC
-0.32
□□□□□ -2.46
SEMA3B
Q13214
RNA5SP470-201
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106 nt
BASIC
-0.32
□□□□□ -2.46
SEMA3B
Q13214
MIR8064-201
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90 nt
BASIC
-0.32
□□□□□ -2.46
SEMA3B
Q13214
MIR4788-201
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80 nt
BASIC
-0.32
□□□□□ -2.46
SEMA3B
Q13214
RNU6-1184P-201
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108 nt
BASIC
-0.33
□□□□□ -2.46
SEMA3B
Q13214
MIR1255A-201
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113 nt
BASIC
-0.33
□□□□□ -2.46
SEMA3B
Q13214
MIR1255B2-201
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BASIC
-0.33
□□□□□ -2.46
SEMA3B
Q13214
RNU6-70P-201
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BASIC
-0.33
□□□□□ -2.46
SEMA3B
Q13214
MIR224-201
ENST00000384889
81 nt
BASIC
-0.34
□□□□□ -2.46
SEMA3B
Q13214
TRAJ28-201
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66 nt
APPRIS P1
BASIC
-0.34
□□□□□ -2.46
SEMA3B
Q13214
SNORD78.1-201
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65 nt
BASIC
-0.34
□□□□□ -2.46
SEMA3B
Q13214
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141 nt
BASIC
-0.34
□□□□□ -2.46
SEMA3B
Q13214
MIR664A-201
ENST00000626086
82 nt
BASIC
-0.34
□□□□□ -2.46
SEMA3B
Q13214
SNORD115-22-201
ENST00000364456
82 nt
BASIC
-0.35
□□□□□ -2.47
SEMA3B
Q13214
RNU6-320P-201
ENST00000516511
106 nt
BASIC
-0.35
□□□□□ -2.47
SEMA3B
Q13214
U7.4-201
ENST00000614961
63 nt
BASIC
-0.35
□□□□□ -2.47
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