Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER39

Tor1a, Torsin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tor1aQ9ER39 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tor1aQ9ER39 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms